40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2542 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2542  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  536  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2236  hypothetical protein  78.68 
 
 		 258 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1257  hypothetical protein  62.02 
 
 		 258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1669  hypothetical protein  59.69 
 
 		 256 aa  328  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1615  hypothetical protein  59.3 
 
 		 256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0943  hypothetical protein  46.78 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5194  hypothetical protein  42.25 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2522  hypothetical protein  43.25 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4458  hypothetical protein  44.83 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2247  hypothetical protein  43.25 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2204  hypothetical protein  45.99 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158703  normal  0.503307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1773  lipoprotein signal peptide  41.67 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0133404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2923  periplasmic protein-like protein  45.06 
 
 		 245 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161015  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0085  hypothetical protein  41 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1070  hypothetical protein  44.49 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2581  hypothetical protein  39.27 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1107  hypothetical protein  42.17 
 
 		 245 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2769  hypothetical protein  42.17 
 
 		 245 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0729  hypothetical protein  36.87 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.870301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1911  periplasmic protein-like protein  43.3 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00932683  normal  0.0114892 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4035  hypothetical protein  39.27 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2800  hypothetical protein  41.27 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.462048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4078  periplasmic protein-like protein  40.99 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0812  periplasmic protein-like  32.59 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4124  hypothetical protein  35.38 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0489181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1908  periplasmic protein-like protein  34.78 
 
 		 309 aa  125  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2357  periplasmic protein-like protein  30.77 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03691  hypothetical protein  30.27 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4181  hypothetical protein  30.27 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0140439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03640  hypothetical protein  30.27 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5254  hypothetical protein  29.36 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  29.36 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4165  periplasmic protein  28.9 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4040  hypothetical protein  28.9 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4193  periplasmic protein  28.9 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  27.16 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  27.16 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  27.65 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  27.06 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4279  f161  25.81 
 
 		 112 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>