40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1070 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1070  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2522  hypothetical protein  78.32 
 
 		 257 aa  371  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2204  hypothetical protein  76.82 
 
 		 255 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158703  normal  0.503307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2247  hypothetical protein  78.32 
 
 		 258 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4458  hypothetical protein  69.74 
 
 		 246 aa  332  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5194  hypothetical protein  68.86 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0943  hypothetical protein  54.11 
 
 		 269 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1773  lipoprotein signal peptide  48.64 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0133404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0085  hypothetical protein  46.22 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2581  hypothetical protein  45.12 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2800  hypothetical protein  48.52 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.462048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4035  hypothetical protein  44.17 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2769  hypothetical protein  45.99 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2923  periplasmic protein-like protein  47.75 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161015  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1107  hypothetical protein  45.57 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4078  periplasmic protein-like protein  48.34 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1911  periplasmic protein-like protein  43.56 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00932683  normal  0.0114892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2542  hypothetical protein  45.06 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1669  hypothetical protein  45.15 
 
 		 256 aa  175  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1615  hypothetical protein  44.73 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1257  hypothetical protein  41.7 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2236  hypothetical protein  41.43 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0812  periplasmic protein-like  38.4 
 
 		 276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1908  periplasmic protein-like protein  46.89 
 
 		 309 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0729  hypothetical protein  35.58 
 
 		 244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.870301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2357  periplasmic protein-like protein  32.99 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4193  periplasmic protein  35.29 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4040  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4165  periplasmic protein  35.29 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4181  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0140439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5254  hypothetical protein  34.84 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03691  hypothetical protein  34.98 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03640  hypothetical protein  34.98 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4124  hypothetical protein  30.18 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0489181 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  28.51 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  28.51 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  34 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  34 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4279  f161  32.5 
 
 		 112 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>