26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4279 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4279  f161  100 
 
 		 112 aa  233  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03691  hypothetical protein  98.21 
 
 		 254 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03640  hypothetical protein  98.21 
 
 		 254 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5254  hypothetical protein  97.32 
 
 		 254 aa  229  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4181  hypothetical protein  97.32 
 
 		 254 aa  229  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0140439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4040  hypothetical protein  97.32 
 
 		 254 aa  229  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4165  periplasmic protein  97.32 
 
 		 254 aa  229  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  97.32 
 
 		 254 aa  229  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4193  periplasmic protein  96.43 
 
 		 254 aa  227  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0729  hypothetical protein  42.03 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.870301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2357  periplasmic protein-like protein  40 
 
 		 266 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4458  hypothetical protein  35.16 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2204  hypothetical protein  35.23 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158703  normal  0.503307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2247  hypothetical protein  39.68 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2522  hypothetical protein  39.68 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5194  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1070  hypothetical protein  32.84 
 
 		 249 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2236  hypothetical protein  29.17 
 
 		 258 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0943  hypothetical protein  27.72 
 
 		 269 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1773  lipoprotein signal peptide  33.33 
 
 		 250 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0133404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2542  hypothetical protein  25.4 
 
 		 258 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2581  hypothetical protein  27.71 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1615  hypothetical protein  26.56 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1669  hypothetical protein  26.56 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1257  hypothetical protein  28.3 
 
 		 258 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1911  periplasmic protein-like protein  31.68 
 
 		 317 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00932683  normal  0.0114892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>