101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3222 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 747 aa  1527    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2779  hypothetical protein  66.55 
 
 		 322 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  30.53 
 
 		 462 aa  217  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  39.66 
 
 		 346 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  38.14 
 
 		 350 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  151  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  32.98 
 
 		 336 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1603  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  33.72 
 
 		 338 aa  144  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  35.96 
 
 		 296 aa  142  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  34.55 
 
 		 352 aa  141  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  30.75 
 
 		 719 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  30.35 
 
 		 728 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  35.42 
 
 		 365 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  27.67 
 
 		 750 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  25.63 
 
 		 617 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  24.44 
 
 		 640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  22.52 
 
 		 632 aa  119  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  28.43 
 
 		 614 aa  118  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  22.91 
 
 		 629 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  22.91 
 
 		 629 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.04 
 
 		 619 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  26.98 
 
 		 322 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  24.93 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  30.57 
 
 		 442 aa  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  23.09 
 
 		 647 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  25.83 
 
 		 302 aa  97.4  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  30.68 
 
 		 345 aa  97.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  26.7 
 
 		 858 aa  96.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  23.86 
 
 		 632 aa  95.5  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  21.97 
 
 		 589 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  27.87 
 
 		 754 aa  85.5  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  22.9 
 
 		 465 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  22.57 
 
 		 596 aa  82.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  32.42 
 
 		 405 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  28.05 
 
 		 397 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  27.85 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  28.57 
 
 		 833 aa  73.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  22.44 
 
 		 519 aa  73.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  19.31 
 
 		 585 aa  73.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  19.31 
 
 		 585 aa  73.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  19.31 
 
 		 585 aa  73.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  32.7 
 
 		 404 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  24.71 
 
 		 598 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  24.1 
 
 		 557 aa  69.3  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  34.72 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.97 
 
 		 383 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  24.41 
 
 		 210 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  25.57 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  35.34 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  27.71 
 
 		 649 aa  63.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  30.65 
 
 		 718 aa  62  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  33.82 
 
 		 559 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  33.82 
 
 		 540 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  33.82 
 
 		 559 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  33.82 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  33.82 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  33.82 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  33.05 
 
 		 596 aa  60.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  33.82 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  26.26 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  24.58 
 
 		 660 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  44.05 
 
 		 486 aa  56.6  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 382 aa  55.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  28.82 
 
 		 413 aa  55.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  36.26 
 
 		 652 aa  55.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  25.72 
 
 		 590 aa  54.7  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  34.52 
 
 		 487 aa  54.3  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  29.03 
 
 		 299 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0433  hypothetical protein  26.01 
 
 		 313 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  24.62 
 
 		 651 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  30.36 
 
 		 467 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1843  hypothetical protein  25.17 
 
 		 319 aa  52.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.17396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  21.93 
 
 		 671 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 331 aa  52.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  30.23 
 
 		 215 aa  51.6  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  26.97 
 
 		 203 aa  51.6  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  24.49 
 
 		 631 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  36.45 
 
 		 361 aa  51.6  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2059  hypothetical protein  24.84 
 
 		 203 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0850085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  30.94 
 
 		 647 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  33.33 
 
 		 420 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0832  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  42.22 
 
 		 61 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  23 
 
 		 541 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  27.57 
 
 		 646 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  22 
 
 		 379 aa  48.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  28.57 
 
 		 750 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  30.95 
 
 		 1118 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  32.29 
 
 		 430 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  24.62 
 
 		 700 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  41.94 
 
 		 402 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  24.24 
 
 		 423 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  17.77 
 
 		 585 aa  45.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  36.71 
 
 		 686 aa  45.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  29.84 
 
 		 556 aa  45.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  35.96 
 
 		 1138 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  34.85 
 
 		 249 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  25.78 
 
 		 529 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1210  hypothetical protein  30.7 
 
 		 179 aa  44.7  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  30.56 
 
 		 447 aa  44.3  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  27.73 
 
 		 304 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>