40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3471  metallophosphoesterase  71.23 
 
 
607 aa  872    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20990  Calcineurin-like phosphoesterase  100 
 
 
628 aa  1291    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972856  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4273  metallophosphoesterase  49.68 
 
 
680 aa  591  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117744  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1080  metallophosphoesterase  41.03 
 
 
659 aa  467  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0645361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0969  metallophosphoesterase  37.48 
 
 
664 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0979  metallophosphoesterase  33.16 
 
 
525 aa  266  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00136331  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3342  hypothetical protein  33.21 
 
 
574 aa  242  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0436  putative calcineurin phosphoesterase  29.63 
 
 
519 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4314  hypothetical protein  32.92 
 
 
571 aa  231  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5374  hypothetical protein  32.12 
 
 
551 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332513  normal  0.110357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1764  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
529 aa  224  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305861  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  28.5 
 
 
470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3771  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
521 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  26.54 
 
 
496 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00842  hypothetical protein  32.32 
 
 
187 aa  78.2  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00260286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06086  hypothetical protein  32.32 
 
 
187 aa  78.2  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  25.48 
 
 
313 aa  62.4  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
374 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  25.44 
 
 
296 aa  55.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05610  hypothetical protein  37.04 
 
 
101 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000456688  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.93 
 
 
299 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.93 
 
 
299 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0208  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
270 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.17 
 
 
229 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.93 
 
 
306 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.93 
 
 
306 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.93 
 
 
306 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.93 
 
 
306 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.36 
 
 
306 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  22.93 
 
 
306 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  23.32 
 
 
304 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2477  metallophosphoesterase  31.72 
 
 
301 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0215204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  28.48 
 
 
295 aa  47.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  24.71 
 
 
319 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  30.11 
 
 
290 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  26.47 
 
 
320 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  25.44 
 
 
318 aa  45.8  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  24.15 
 
 
309 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1990  metallophosphoesterase  23.55 
 
 
747 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  25.93 
 
 
312 aa  44.3  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>