42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3342 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4314  hypothetical protein  84.67 
 
 		 571 aa  957    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3342  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1148    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5374  hypothetical protein  60.32 
 
 		 551 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332513  normal  0.110357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0979  metallophosphoesterase  34.92 
 
 		 525 aa  303  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00136331  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0436  putative calcineurin phosphoesterase  34.16 
 
 		 519 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1764  metallophosphoesterase  35.09 
 
 		 529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305861  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1080  metallophosphoesterase  32.81 
 
 		 659 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4273  metallophosphoesterase  32.51 
 
 		 680 aa  244  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117744  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20990  Calcineurin-like phosphoesterase  33.21 
 
 		 628 aa  242  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972856  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3471  metallophosphoesterase  32.57 
 
 		 607 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0969  metallophosphoesterase  30.78 
 
 		 664 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  24.76 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  25.81 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3771  metallophosphoesterase  21.63 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00842  hypothetical protein  36.46 
 
 		 187 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00260286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06086  hypothetical protein  36.46 
 
 		 187 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  29.43 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05610  hypothetical protein  48.19 
 
 		 101 aa  78.2  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000456688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  24.91 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  28.18 
 
 		 309 aa  57  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.64 
 
 		 306 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  28.64 
 
 		 306 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.64 
 
 		 306 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.64 
 
 		 306 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.64 
 
 		 306 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.68 
 
 		 306 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.64 
 
 		 299 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.64 
 
 		 299 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1563  metallophosphoesterase  33.1 
 
 		 322 aa  53.9  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  31.88 
 
 		 319 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.64 
 
 		 229 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  28.78 
 
 		 343 aa  52  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  33.11 
 
 		 320 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  27.98 
 
 		 313 aa  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  32.2 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  27.86 
 
 		 335 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  28.18 
 
 		 318 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  28.06 
 
 		 296 aa  48.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  29.38 
 
 		 313 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  30.43 
 
 		 314 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3329  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.99 
 
 		 279 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0264  metallophosphoesterase  25.74 
 
 		 306 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.019445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>