54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4273 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4273  metallophosphoesterase  100 
 
 
680 aa  1377    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117744  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20990  Calcineurin-like phosphoesterase  48.45 
 
 
628 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972856  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3471  metallophosphoesterase  49.19 
 
 
607 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1080  metallophosphoesterase  46.7 
 
 
659 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0645361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0969  metallophosphoesterase  43.31 
 
 
664 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0979  metallophosphoesterase  30.73 
 
 
525 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00136331  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4314  hypothetical protein  33.06 
 
 
571 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5374  hypothetical protein  32.99 
 
 
551 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332513  normal  0.110357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3342  hypothetical protein  32.51 
 
 
574 aa  244  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0436  putative calcineurin phosphoesterase  29.47 
 
 
519 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1764  metallophosphoesterase  28.69 
 
 
529 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305861  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  27.46 
 
 
496 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3771  metallophosphoesterase  25.32 
 
 
521 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  25.65 
 
 
470 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00842  hypothetical protein  31.84 
 
 
187 aa  94  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00260286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06086  hypothetical protein  31.84 
 
 
187 aa  94  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.68 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.68 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.68 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.68 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  32.68 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.68 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.68 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.68 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.17 
 
 
229 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
295 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  28.29 
 
 
296 aa  61.6  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  26.45 
 
 
313 aa  61.2  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  28.64 
 
 
374 aa  61.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05610  hypothetical protein  41.67 
 
 
101 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000456688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  32.23 
 
 
335 aa  56.6  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  28.12 
 
 
309 aa  57  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  33.05 
 
 
320 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  30.51 
 
 
319 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1302  metallophosphoesterase  25.94 
 
 
594 aa  51.2  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  26.24 
 
 
289 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  28.45 
 
 
318 aa  49.7  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2547  metallophosphoesterase  26.18 
 
 
306 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2770  metallophosphoesterase  25.75 
 
 
301 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  30.51 
 
 
314 aa  47.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1990  metallophosphoesterase  23.41 
 
 
747 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2477  metallophosphoesterase  27.32 
 
 
301 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0215204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  24.64 
 
 
382 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
314 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
314 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  30.08 
 
 
312 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
314 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  23.64 
 
 
252 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  23.08 
 
 
303 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
286 aa  44.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  25.77 
 
 
313 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
314 aa  45.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0208  metallophosphoesterase  24 
 
 
270 aa  44.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2539  hypothetical protein  23.89 
 
 
280 aa  44.3  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>