22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2539 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2539  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2785  metallophosphoesterase  49.08 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2381  metallophosphoesterase  48.34 
 
 
276 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2032  hypothetical protein  42.65 
 
 
278 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136502  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0024  hypothetical protein  42 
 
 
276 aa  209  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000144277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0208  metallophosphoesterase  40.47 
 
 
270 aa  202  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0237  metallophosphoesterase  36.3 
 
 
267 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00113415  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2547  metallophosphoesterase  27.8 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2770  metallophosphoesterase  27.8 
 
 
301 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0967  metallophosphoesterase  25.27 
 
 
281 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2477  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
301 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0215204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1478  twin-arginine translocation pathway signal  27.24 
 
 
314 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0847  metallophosphoesterase  26.18 
 
 
281 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5807  predicted protein  30.95 
 
 
191 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.731191  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1238  hypothetical protein  29.64 
 
 
286 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9280  predicted protein  24.68 
 
 
329 aa  79  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047063  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1563  metallophosphoesterase  28.33 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  24.7 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5767  predicted protein  24.46 
 
 
331 aa  49.3  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  21.95 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4273  metallophosphoesterase  23.89 
 
 
680 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117744  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5386  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>