215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0994 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  100 
 
 		 396 aa  789    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  52.47 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  38.99 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  35.73 
 
 		 378 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  35.2 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  33.85 
 
 		 375 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  34.95 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.24 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  32.58 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  32.23 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  34.95 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  31.64 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  31.89 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  30.75 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  31.67 
 
 		 409 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  30.95 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  28.94 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  29.34 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  32.73 
 
 		 417 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  32.96 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  32.68 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  30.3 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  28.79 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  30.56 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  29.6 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  28.53 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  30.27 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  30.27 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  29.85 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  23.55 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  23.21 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  26.06 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  26.2 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  26.52 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  22.59 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  26.55 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  26.55 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  26.55 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  23.19 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.47 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  24.27 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  25.76 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.47 
 
 		 379 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  24.42 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  24.71 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  25.97 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  25.42 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  27.01 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  23.05 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.1 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  23.74 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  26.45 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  24.92 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  23.74 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  28.92 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  25.22 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  25.16 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  23.08 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  25.64 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  26.82 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  21.97 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27.17 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  27.74 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  26.09 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  25.19 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  24.61 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  25.81 
 
 		 392 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.46 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  25.63 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  24.48 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  24.37 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  22.75 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  27.08 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  28.67 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  31.37 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  33.88 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  25.76 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  25.33 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  24.15 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  22.3 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  25.33 
 
 		 382 aa  53.1  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  25.2 
 
 		 361 aa  53.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.17 
 
 		 386 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.05 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.48 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  23.77 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.1 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  24.63 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  30.28 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  25.23 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  23.02 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  24.36 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  37.23 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  25.68 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  32.26 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  24.53 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  24.53 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  24.53 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.92 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  24.53 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>