271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01060 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  100 
 
 		 409 aa  833    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  37.5 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  34.46 
 
 		 381 aa  229  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  34.72 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.71 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  32.67 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  31.89 
 
 		 381 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  32.43 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  32.43 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  32.43 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  32.69 
 
 		 380 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.76 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.76 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  32.52 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  33.73 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.6 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  32.43 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  33.17 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  33.73 
 
 		 385 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  31.22 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  31.63 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  31.71 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  33.75 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  33.5 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  33.5 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  33.5 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  33.5 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  33.08 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  33.25 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  33.42 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  31.65 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  30.32 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  32.33 
 
 		 372 aa  176  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  30.64 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  32.49 
 
 		 386 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  31.41 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  28.99 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  28.99 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  27.83 
 
 		 374 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  28.22 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  27.09 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.18 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  29.23 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  30.17 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  30.06 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.02 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  31.2 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  27.49 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.71 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.33 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  31.88 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.75 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  28.88 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.25 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  29.75 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.4 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  30.14 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  32.1 
 
 		 320 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  29.25 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.89 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  31.04 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  32.77 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  27.9 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  28.98 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  28.89 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  26.6 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  27.83 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  29.69 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.06 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  26.23 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  27.01 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  27.03 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  29.55 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  27.97 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  28.45 
 
 		 409 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  27.03 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  29.79 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  26.01 
 
 		 506 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  25.18 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  30.52 
 
 		 414 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  30.56 
 
 		 537 aa  99  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.6 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  29.9 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  26.44 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  29.6 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  27.08 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  32.14 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  30.39 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  27.63 
 
 		 425 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  27.07 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  27.07 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  27.07 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  26.97 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.06 
 
 		 528 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  26.4 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  27.07 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  27.07 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  27.07 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  27.93 
 
 		 517 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>