210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2079 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 
410 aa  840    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  50.24 
 
 
409 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  49.27 
 
 
409 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  48.56 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  48.07 
 
 
414 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  48.29 
 
 
408 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  47.17 
 
 
410 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  45.5 
 
 
410 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  45.34 
 
 
416 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  41.85 
 
 
498 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  44.72 
 
 
411 aa  359  5e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  54.78 
 
 
517 aa  317  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  53.31 
 
 
528 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  49.47 
 
 
537 aa  301  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  39.07 
 
 
404 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  37.2 
 
 
414 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  37.28 
 
 
408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  37.89 
 
 
414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  38.29 
 
 
406 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  36.87 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  35.58 
 
 
412 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  35.61 
 
 
410 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  36 
 
 
425 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  35.12 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  35.12 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  35.12 
 
 
414 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  36.41 
 
 
442 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  36.25 
 
 
401 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  38.9 
 
 
423 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  32.82 
 
 
483 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  36.68 
 
 
410 aa  255  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  35.77 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  35.77 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  35.77 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  35.77 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  35.77 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  35.77 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  35.77 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  36.67 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  36.67 
 
 
400 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  36.67 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  35.94 
 
 
506 aa  253  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  35.06 
 
 
410 aa  253  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  36.67 
 
 
400 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  35.52 
 
 
400 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  35.66 
 
 
425 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  36.43 
 
 
400 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  35.01 
 
 
400 aa  249  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  37.32 
 
 
406 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  34.12 
 
 
515 aa  246  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  34.01 
 
 
409 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  33.75 
 
 
409 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  34.98 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  32.66 
 
 
412 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  32.41 
 
 
412 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  32.91 
 
 
412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  32.91 
 
 
412 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  33.92 
 
 
414 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.04 
 
 
428 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  33.8 
 
 
419 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  33.16 
 
 
414 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  30.57 
 
 
414 aa  183  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  29.51 
 
 
407 aa  178  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.9 
 
 
414 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  32.66 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  30.47 
 
 
392 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  29.81 
 
 
467 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.66 
 
 
418 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  32.74 
 
 
425 aa  155  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  27.98 
 
 
409 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  30.88 
 
 
382 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  29.32 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  31.33 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.32 
 
 
407 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  31.38 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  26.52 
 
 
413 aa  140  4.999999999999999e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  29.61 
 
 
405 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  28.81 
 
 
382 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  32.21 
 
 
415 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  31.66 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  29.97 
 
 
415 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.46 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  29.91 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  28.57 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.52 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  26.71 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  25.36 
 
 
395 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.16 
 
 
400 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  30.1 
 
 
387 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  29.84 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.15 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  30.23 
 
 
381 aa  126  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  27.76 
 
 
381 aa  126  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  27.46 
 
 
381 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  27.46 
 
 
381 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  30 
 
 
382 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.59 
 
 
407 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  30.54 
 
 
386 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  28.61 
 
 
380 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  27.46 
 
 
381 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>