251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2306 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 392 aa  775    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  74.23 
 
 		 390 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  54.27 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  52.21 
 
 		 386 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  48.22 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  48.97 
 
 		 375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  50 
 
 		 366 aa  325  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  49.22 
 
 		 386 aa  322  9.000000000000001e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  50.38 
 
 		 390 aa  299  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  45.41 
 
 		 382 aa  296  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  46.42 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  45.95 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  44.19 
 
 		 407 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  46.56 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  43.7 
 
 		 379 aa  255  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  44.72 
 
 		 394 aa  249  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  43.62 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  40.51 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  40.36 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  36.25 
 
 		 377 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  34.27 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  34.27 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  35.04 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  35.86 
 
 		 380 aa  212  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  35.65 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  40.61 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  35.04 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  34.27 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  34.78 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  34.02 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  34.02 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.93 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.61 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  33 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.61 
 
 		 400 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  32.91 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  33.17 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  36.25 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  32.91 
 
 		 385 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  32.91 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  32.91 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  32.91 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  37.66 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  37.8 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  32.65 
 
 		 385 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  32.41 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  33.7 
 
 		 388 aa  192  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  31.74 
 
 		 385 aa  189  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  36.45 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  30.65 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  29.79 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  30.96 
 
 		 372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  35.19 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  27.62 
 
 		 373 aa  169  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  27.62 
 
 		 373 aa  169  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  36.84 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  27.57 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  32.14 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  26.43 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  37.34 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  32.91 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.91 
 
 		 383 aa  146  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  36.16 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  36.16 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  32.62 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  36.04 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  35.38 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  35.78 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  37.25 
 
 		 414 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  36.1 
 
 		 392 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  36.84 
 
 		 409 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  30.03 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  37.25 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  30.52 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  31.68 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  32.26 
 
 		 388 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  35.31 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.85 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  33.24 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  32.24 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  30.87 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  29.27 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.53 
 
 		 528 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  29.68 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  31.02 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.07 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  30.15 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  33.33 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  30.98 
 
 		 400 aa  129  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  30.98 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  30.98 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  29.14 
 
 		 414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  29.14 
 
 		 414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  30.98 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  31.79 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  30.98 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  29.14 
 
 		 414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  30.98 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  30.98 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  29.55 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>