252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2961 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 390 aa  749    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  53.42 
 
 		 366 aa  362  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  50.53 
 
 		 375 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  53.7 
 
 		 386 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  47.78 
 
 		 385 aa  315  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  50.4 
 
 		 386 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  49.36 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  49.74 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  51.56 
 
 		 389 aa  297  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  50.53 
 
 		 392 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  48.07 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  48.81 
 
 		 382 aa  289  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  47.24 
 
 		 407 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  46.65 
 
 		 418 aa  263  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  50 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  45.31 
 
 		 379 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  44.59 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  46.41 
 
 		 407 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  39.76 
 
 		 381 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  39.45 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  39.45 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  42.56 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  39.45 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  44.56 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  37.92 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  42.78 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  39.45 
 
 		 381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.24 
 
 		 400 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.98 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  34.87 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  39.88 
 
 		 400 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  36.2 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  36.2 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  36.81 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  38.23 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  33.84 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  33.84 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  34.15 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  30.33 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  29.49 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  30.3 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  31.5 
 
 		 385 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  30.48 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  30.63 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  30.63 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  30.63 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  30.63 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  30.63 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  30.38 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  33.43 
 
 		 375 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  33.16 
 
 		 372 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  30.63 
 
 		 385 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  28.57 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  28.57 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  35.49 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  33.88 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  25.85 
 
 		 374 aa  169  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  35.81 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  35.81 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  36.22 
 
 		 392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  35.81 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  40.2 
 
 		 406 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  35.81 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  35.81 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  38.28 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  35.81 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  36.08 
 
 		 400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  33.53 
 
 		 400 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  39.09 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  36.18 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  35.74 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  35.47 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  35.47 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  32.42 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  32.12 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  33.03 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  33.53 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  35.74 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  39.93 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  37.97 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  30.29 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  36.01 
 
 		 410 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  31.38 
 
 		 498 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  30.79 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.79 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  32.47 
 
 		 414 aa  149  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  32.15 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  30.52 
 
 		 425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  33.93 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  28.9 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.46 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  33.11 
 
 		 410 aa  146  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  27.65 
 
 		 390 aa  145  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  31.43 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  34.46 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  33.22 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  29 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  31.88 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  27.32 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  28.57 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>