281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  100 
 
 		 386 aa  760    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  66.67 
 
 		 382 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  61.21 
 
 		 383 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  54.28 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  56.68 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  53.99 
 
 		 386 aa  362  8e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  53.56 
 
 		 379 aa  352  8e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  51.19 
 
 		 375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  51.6 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  50.4 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  47.87 
 
 		 418 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  48.57 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  48.62 
 
 		 407 aa  306  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  48.53 
 
 		 392 aa  299  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  47.81 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  49.49 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  35.77 
 
 		 379 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  36.31 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  39.48 
 
 		 383 aa  232  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  45.6 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  41.04 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  35.7 
 
 		 381 aa  229  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  39.58 
 
 		 386 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  37 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  37 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  36.39 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  37.02 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  36.73 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  38.03 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  38.89 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  38.96 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  36.73 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  40.91 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.6 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  36 
 
 		 380 aa  219  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  34.18 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  34.18 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  34.18 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  34.84 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  33.93 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  34.18 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  33.93 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  33.67 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  34.04 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  34.21 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  33.67 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  33.16 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  34.29 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  32.4 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  34.03 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  29.24 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  32.11 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  33.16 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  29.17 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  27.27 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  28.12 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  28.12 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  31.3 
 
 		 372 aa  173  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  34.63 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  32.7 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  36.86 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.25 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  31 
 
 		 390 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  33.44 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  32.44 
 
 		 414 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  32.44 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  34.5 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  32.44 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  30.61 
 
 		 408 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  33.67 
 
 		 410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  32.76 
 
 		 401 aa  145  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  32.23 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  34.92 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  33.44 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  33.66 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  37.87 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  33.83 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  28.43 
 
 		 413 aa  142  8e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  34.51 
 
 		 393 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  30.19 
 
 		 442 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  36.36 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  34.52 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  31.75 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  37.01 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  33.99 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  29.71 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  31.21 
 
 		 400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  30.91 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  28.9 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.9 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  31.03 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  31.21 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  30.3 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  35.03 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  32.21 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  30.91 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  38.23 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  36.71 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  32.21 
 
 		 400 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  33.67 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>