211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0170 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  100 
 
 		 383 aa  784    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  32.34 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.6 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.43 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.43 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  30.21 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  31.86 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  30.29 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  31.59 
 
 		 381 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  31.59 
 
 		 381 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  31.59 
 
 		 381 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  30.97 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  30.93 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  31.59 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  31.25 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  31.44 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.52 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  28.84 
 
 		 381 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  30.13 
 
 		 388 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  32.54 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  30.83 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  35.08 
 
 		 374 aa  169  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  30.51 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  31.65 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.73 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  30.15 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.7 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  32.33 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  30.51 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  30.37 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.75 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.15 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  29.66 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  31.71 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  30.06 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  27.3 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  28.62 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  31.1 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  27.94 
 
 		 374 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.25 
 
 		 386 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  29.66 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  29.66 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  29.66 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  29.66 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  29.66 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  29.66 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  29.66 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  30.37 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  29.38 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.11 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  35.38 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  28 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.69 
 
 		 394 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  29.46 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  27.75 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  27.75 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  29.34 
 
 		 371 aa  145  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  29.33 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  28.61 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  31.86 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  34.6 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  25.42 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  29.07 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  28.33 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  26.51 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  25.85 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  31.06 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  28.92 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  26.3 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  29.66 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  28.37 
 
 		 409 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.97 
 
 		 416 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  25.61 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  25.24 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  24.63 
 
 		 408 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  26.3 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  27.46 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  23.9 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  25.39 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  30.04 
 
 		 408 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.74 
 
 		 435 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  27.63 
 
 		 409 aa  106  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  26.35 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  27.36 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  27.47 
 
 		 390 aa  105  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  28.06 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  27.68 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  26.46 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  24.21 
 
 		 410 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  26.47 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  24.18 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  29.5 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.5 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  26.47 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  25.16 
 
 		 400 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  26.06 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  25.16 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  26.21 
 
 		 515 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  26.6 
 
 		 537 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  26.77 
 
 		 414 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>