295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1407 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 
373 aa  763    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 
373 aa  763    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  65.15 
 
 
374 aa  515  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.89 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  33.33 
 
 
381 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  36.32 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  34.21 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.68 
 
 
400 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.68 
 
 
400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  33.42 
 
 
381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  32.45 
 
 
383 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  33.51 
 
 
381 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.9 
 
 
400 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  32.04 
 
 
385 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  32.04 
 
 
385 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  32.3 
 
 
385 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  32.04 
 
 
385 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  32.04 
 
 
385 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  32.71 
 
 
399 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  32.05 
 
 
385 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  33.6 
 
 
380 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  34.67 
 
 
379 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  31.27 
 
 
385 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  36.51 
 
 
374 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  33.51 
 
 
379 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  32.99 
 
 
385 aa  222  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  32.02 
 
 
381 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  31.76 
 
 
381 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  31.76 
 
 
381 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  31.69 
 
 
385 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  31.01 
 
 
385 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  34.13 
 
 
377 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  31.5 
 
 
381 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  32.46 
 
 
381 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  32.11 
 
 
381 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  30.93 
 
 
372 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  34.3 
 
 
375 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  29.1 
 
 
386 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  29.03 
 
 
366 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  29.6 
 
 
375 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  29.75 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  30.08 
 
 
390 aa  184  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.08 
 
 
386 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  28.31 
 
 
390 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.61 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.12 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  28.68 
 
 
379 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  31 
 
 
392 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  26.7 
 
 
379 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  29.06 
 
 
383 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  35.48 
 
 
402 aa  169  7e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  28.38 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  28.53 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  25.39 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  28.99 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  27.15 
 
 
407 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.43 
 
 
390 aa  162  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  27.44 
 
 
392 aa  156  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  25.8 
 
 
407 aa  156  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.89 
 
 
394 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  28.57 
 
 
320 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.52 
 
 
387 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  29.84 
 
 
393 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  27.69 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.75 
 
 
383 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  29.05 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.75 
 
 
435 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  27.2 
 
 
407 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.94 
 
 
407 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  24.47 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  30.6 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  26.8 
 
 
425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  25.2 
 
 
408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.74 
 
 
418 aa  116  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  31.01 
 
 
412 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  31.01 
 
 
412 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  30.71 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  27.63 
 
 
409 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  29.84 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  28.08 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  29.92 
 
 
412 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  26.92 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  30.43 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  28.41 
 
 
418 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  30.2 
 
 
409 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  28.06 
 
 
410 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  26.64 
 
 
425 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.98 
 
 
414 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  33.09 
 
 
406 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  24.08 
 
 
409 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  31.84 
 
 
414 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  27.55 
 
 
425 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  23.5 
 
 
404 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  25 
 
 
423 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  27.36 
 
 
423 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  31.16 
 
 
408 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  31.82 
 
 
414 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  25.67 
 
 
387 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  25.08 
 
 
414 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>