254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000032 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  100 
 
 		 377 aa  778    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  88.06 
 
 		 379 aa  701    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  68.17 
 
 		 379 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  52.38 
 
 		 381 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  51.47 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  52.49 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  52.23 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  51.47 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  54.4 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  51.47 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  51.47 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  51.73 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  51.71 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  50.93 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  50.26 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  49.07 
 
 		 380 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  46.21 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  41.19 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  40.78 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  41.6 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  40.78 
 
 		 385 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  40.41 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  39.74 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  40.93 
 
 		 385 aa  299  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  40.93 
 
 		 385 aa  299  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  40.93 
 
 		 385 aa  299  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  40.93 
 
 		 385 aa  299  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  40.74 
 
 		 383 aa  299  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  40.26 
 
 		 385 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  40.93 
 
 		 385 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  40.32 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  37.04 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  36.31 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  39.15 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  35.53 
 
 		 385 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  33.51 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.57 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  38.89 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  34.29 
 
 		 386 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  34.13 
 
 		 373 aa  218  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  34.13 
 
 		 373 aa  218  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  37.33 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  37.5 
 
 		 320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.5 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  32.9 
 
 		 375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  31.48 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  32.11 
 
 		 379 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  36.59 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  35.95 
 
 		 382 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  35.8 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  33.84 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  35.95 
 
 		 392 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  35.65 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  31.22 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.91 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  31.2 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  29.08 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  35.9 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.45 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.12 
 
 		 394 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  28.12 
 
 		 371 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  33.63 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  33.56 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  31.1 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  27.97 
 
 		 392 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  32.21 
 
 		 410 aa  146  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  30.26 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  30.2 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  32.28 
 
 		 498 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  34.44 
 
 		 414 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  33.45 
 
 		 418 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  29.83 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  31.95 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  32.13 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  28.4 
 
 		 483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  35.14 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  29.49 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.49 
 
 		 418 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  30.36 
 
 		 409 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  30.23 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  30.23 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  30.23 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  29.05 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  29.49 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  29.05 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  29.9 
 
 		 410 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  30.29 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  33 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  29.73 
 
 		 423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  29.87 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  28.53 
 
 		 515 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  28.43 
 
 		 537 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  27.91 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  28.23 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  29.24 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  29.51 
 
 		 412 aa  126  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  27.64 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  31.61 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  27.55 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.84 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>