170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2390 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  100 
 
 		 320 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  97.81 
 
 		 385 aa  645    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  97.81 
 
 		 385 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  97.19 
 
 		 385 aa  641    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  97.81 
 
 		 385 aa  645    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  97.5 
 
 		 385 aa  644    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  98.44 
 
 		 385 aa  649    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  94.38 
 
 		 385 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  93.44 
 
 		 385 aa  623  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  92.5 
 
 		 385 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  88.12 
 
 		 385 aa  592  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  38.17 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  37.5 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  34.98 
 
 		 381 aa  215  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  35.71 
 
 		 381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  34.27 
 
 		 383 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  35 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  35.71 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  37.1 
 
 		 379 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  34.78 
 
 		 381 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  36.88 
 
 		 380 aa  198  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.65 
 
 		 400 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.33 
 
 		 400 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.33 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  34.78 
 
 		 381 aa  192  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  34.47 
 
 		 381 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.87 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  34.16 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  34.16 
 
 		 381 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  34.16 
 
 		 381 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  34.16 
 
 		 381 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  33.13 
 
 		 399 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  31.25 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  33.01 
 
 		 375 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  29.97 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  32.7 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  32.48 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  31.13 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  31.96 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  28.57 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  28.57 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  30.35 
 
 		 385 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.55 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  33.2 
 
 		 382 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  27.59 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  32.1 
 
 		 409 aa  136  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  28.62 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  29.45 
 
 		 375 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  27.78 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  31.2 
 
 		 407 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.13 
 
 		 387 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  29.49 
 
 		 366 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.04 
 
 		 390 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  29.87 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  26.89 
 
 		 402 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  27.56 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.03 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.1 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  24.04 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  27.56 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.26 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  28.52 
 
 		 389 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  24.5 
 
 		 409 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.91 
 
 		 407 aa  91.3  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  26.21 
 
 		 408 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  24.7 
 
 		 435 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  32.14 
 
 		 393 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  30.5 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  24.58 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  25.67 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  27.35 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.35 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  30.43 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  30.28 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  29.88 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  29.38 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  29.08 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  31.53 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  29 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  26.45 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  24.71 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.85 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  31.75 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  32.45 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  26.67 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  27.65 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.35 
 
 		 418 aa  69.3  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  25.88 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  27.98 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  25.87 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  24.76 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.36 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  29.74 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  28.99 
 
 		 409 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  22.59 
 
 		 425 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  24.85 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  22.74 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  29.69 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  24.28 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>