267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0204 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 405 aa  816    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  54.95 
 
 		 409 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  55.77 
 
 		 407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  55.28 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  48.55 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  42.82 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  38.93 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  38.37 
 
 		 425 aa  299  8e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  36.28 
 
 		 408 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  34.13 
 
 		 406 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  30.33 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  30.2 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  28.87 
 
 		 395 aa  162  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  28.78 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  28.86 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  28.68 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.01 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.78 
 
 		 400 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  29.18 
 
 		 387 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.78 
 
 		 400 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  28.03 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  27.95 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  35.25 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  27.21 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  30.97 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  33.69 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  30.69 
 
 		 374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.9 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  30.68 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  29.24 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  32.83 
 
 		 498 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  33.89 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  30.81 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  32.32 
 
 		 381 aa  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  32.55 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  30.55 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  31.76 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  31.76 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  31.76 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.14 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  28.64 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  28.88 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  29.61 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  28.64 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  29.26 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  28.64 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  28.64 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  28.64 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  28.64 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  28.64 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  28.22 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.11 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  27.66 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  29.91 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  29.61 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  34.78 
 
 		 377 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  29.53 
 
 		 388 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.96 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.7 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  32.73 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.85 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  29.62 
 
 		 375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  27.68 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  35.61 
 
 		 386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  24.82 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  27.51 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.61 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  29.07 
 
 		 392 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  32.11 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  26.7 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  30.16 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  31.21 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  27.12 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  29.05 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  30.39 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.01 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  29.05 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  30.67 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  31.54 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  26.44 
 
 		 409 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  27.12 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  31.8 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  26.89 
 
 		 400 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  31.23 
 
 		 415 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.73 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  29.83 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  26.89 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  29.25 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  24.78 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.97 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  29.75 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  26.46 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  26.9 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  30.7 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  31.23 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  31.25 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  30 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  25.91 
 
 		 408 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  31.97 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  26.76 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>