244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1552 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  94.5 
 
 		 382 aa  700    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 382 aa  757    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  61.68 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  49.74 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  48.96 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  49.48 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  35.63 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  31.14 
 
 		 408 aa  176  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  34.54 
 
 		 425 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  35.22 
 
 		 410 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  32.23 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  34.86 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  28.97 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  34.43 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  35 
 
 		 414 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  35 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  35 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  33.84 
 
 		 414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  35.41 
 
 		 406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  37 
 
 		 392 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  32.57 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  30.88 
 
 		 410 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  31.79 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  34.3 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  32.36 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  30.67 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  33.33 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  33.11 
 
 		 410 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  33.23 
 
 		 400 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  32.33 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  33.23 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  33.23 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  32.7 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  33.23 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  33.23 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  31.79 
 
 		 414 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  38.23 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  31.45 
 
 		 400 aa  143  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  26.97 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  31.76 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.97 
 
 		 407 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  31.76 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  31.76 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  31.76 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  31.76 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  31.76 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  31.76 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  35 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  30.49 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  30.35 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  29.41 
 
 		 414 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  27.87 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  31.45 
 
 		 400 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.6 
 
 		 435 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  31.5 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  32.65 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  32.31 
 
 		 406 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  31.82 
 
 		 425 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  33.87 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  30.53 
 
 		 506 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  30.94 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  35.33 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  31.94 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  32.46 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  29.67 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  30.87 
 
 		 385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  29.78 
 
 		 498 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.44 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  33.05 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  34.95 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  29.53 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  27.86 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  30.86 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  30.24 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.67 
 
 		 414 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  31.49 
 
 		 537 aa  127  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  29.59 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  29.18 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.01 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  24.44 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  33.08 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  30 
 
 		 412 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.56 
 
 		 400 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.11 
 
 		 418 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  32.85 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.21 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  31.14 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  38.35 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  33.45 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  27.11 
 
 		 372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  28.87 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  28.87 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  28.87 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  32.29 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  31.37 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  28.27 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.33 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  28.87 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>