287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3776 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 387 aa  771    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  65.28 
 
 		 388 aa  484  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  50.13 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  50.39 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  50 
 
 		 382 aa  319  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  49.35 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  38.25 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  40 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  39.02 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  37.65 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  30.2 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  35.51 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  35.58 
 
 		 425 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.19 
 
 		 435 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  27.41 
 
 		 407 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.41 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  34.97 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  29.44 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  38.71 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  35.26 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  33.55 
 
 		 414 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  33.23 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  32.05 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  32.81 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  36.56 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  28.95 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  34.32 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  31.43 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  32.79 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.88 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  30.86 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.88 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  30.86 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  30.37 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  28.3 
 
 		 410 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  31.13 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.51 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  25.81 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  30.29 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.82 
 
 		 400 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  26.92 
 
 		 412 aa  136  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  31.58 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  29.58 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  29.58 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  29.58 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  31.25 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  34.31 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  31.68 
 
 		 392 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  26.36 
 
 		 380 aa  132  7.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  28.54 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  28.25 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  29.77 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  28.79 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  28.79 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  28.79 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  28.79 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  28.79 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  28.61 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  26.13 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  28.79 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  28.86 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  28.54 
 
 		 400 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  27.59 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.26 
 
 		 416 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  30.77 
 
 		 406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  30.99 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  30.46 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  25.65 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  28.81 
 
 		 400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  31.79 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  30.55 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  28.12 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.22 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  28.81 
 
 		 400 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  28.81 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  30.48 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  32.16 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  24.55 
 
 		 414 aa  125  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  28.81 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  31.31 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  27.44 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  29.13 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  27.58 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  28.95 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.71 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  30.65 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.64 
 
 		 407 aa  122  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  31.9 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  36.05 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  32.73 
 
 		 381 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  31.42 
 
 		 381 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  27.56 
 
 		 483 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  25.47 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  26.43 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  28.17 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  31.86 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.6 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  31.94 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  27.15 
 
 		 385 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  33.05 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>