238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0206 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 407 aa  825    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  99.51 
 
 		 407 aa  823    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  70.17 
 
 		 409 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  54.91 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  42.2 
 
 		 435 aa  332  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  39.95 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  40.1 
 
 		 392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  38.89 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  33.01 
 
 		 408 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  31.19 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  29.35 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  31.38 
 
 		 385 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  31.38 
 
 		 385 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  31.38 
 
 		 385 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  31.38 
 
 		 385 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  27.41 
 
 		 387 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  32.07 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  30.18 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  30.84 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  27.82 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  31.38 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  27.03 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  27.49 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  29.44 
 
 		 498 aa  143  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  30.38 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  29.32 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  27.8 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  31.58 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  24.7 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  26.8 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  25.92 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  25.55 
 
 		 381 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  30.58 
 
 		 385 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  30 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  30.69 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.51 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.51 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  25.55 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.04 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  26.67 
 
 		 404 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  31.03 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.86 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  30.25 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  28.94 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  27.85 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  31.44 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  25.39 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  25.58 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  31.7 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.4 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  25.19 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  28.7 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  27.79 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  28.57 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  25.12 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  27.87 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.69 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.63 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.57 
 
 		 390 aa  131  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  23.5 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.67 
 
 		 386 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.7 
 
 		 416 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  29.41 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  23.5 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  23.5 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  27.25 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  23.76 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  23.5 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.48 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  24.38 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  26.7 
 
 		 423 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  31.69 
 
 		 379 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  25.39 
 
 		 400 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  30.41 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  27.57 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  24.76 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  24.44 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  25.35 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  24.76 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  25.54 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  29.35 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  26.08 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  24.76 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  25.13 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  25.13 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  24.76 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  25.13 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  25.13 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  23.63 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  29.77 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  25.13 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  25.49 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  25.13 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  24.76 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  27.47 
 
 		 506 aa  123  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  26.08 
 
 		 400 aa  123  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  24.11 
 
 		 381 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  25.13 
 
 		 388 aa  122  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  23.24 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  27.76 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>