259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04020 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  100 
 
 		 435 aa  902    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  49.12 
 
 		 405 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  42.89 
 
 		 409 aa  345  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  42.2 
 
 		 407 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  42.2 
 
 		 407 aa  335  9e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  40.2 
 
 		 392 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  40.05 
 
 		 393 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  36.69 
 
 		 425 aa  275  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  33.99 
 
 		 408 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  31.81 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  31.23 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  27.51 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  28.39 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  29.15 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  28.95 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  28.95 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  28.95 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  27.32 
 
 		 390 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  28.95 
 
 		 381 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  26.54 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  26.54 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  26.54 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  26.54 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  34.19 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  26.54 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  29.11 
 
 		 381 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  26.54 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  29.68 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.99 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  28.82 
 
 		 383 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  30.92 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.11 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  29.25 
 
 		 498 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.11 
 
 		 400 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.07 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  29.34 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  27.76 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  31.37 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  26.04 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  32.38 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  28.65 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  25.25 
 
 		 385 aa  136  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  32.74 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  32.24 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.48 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  31.6 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  27.69 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  27.68 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  32.24 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.51 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  25.46 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  25.31 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  30.72 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.21 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  30.18 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  28.21 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.07 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  31.72 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  25.55 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  28.32 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.19 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  27.09 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  32.71 
 
 		 382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  33.79 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  29.59 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  32.71 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.94 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  27.68 
 
 		 374 aa  130  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  31.16 
 
 		 392 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  28.07 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  31.74 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.56 
 
 		 528 aa  127  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  30.14 
 
 		 377 aa  127  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  32.87 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  27.76 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  34.35 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  29.43 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  31.85 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.07 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  24.16 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  26.21 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.29 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  32.77 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  29.76 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  32.47 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  27.76 
 
 		 400 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  29.14 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  27.48 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  29.64 
 
 		 410 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  30.14 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  31.75 
 
 		 373 aa  123  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  31.75 
 
 		 373 aa  123  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  29.33 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  28.2 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  30.8 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  29.82 
 
 		 537 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  27.48 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  29.55 
 
 		 372 aa  121  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  27.68 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  29.28 
 
 		 379 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>