207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0282 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 425 aa  848    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  50 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  48.76 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  38.8 
 
 		 409 aa  295  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  38.37 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  38.89 
 
 		 407 aa  289  8e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  38.65 
 
 		 407 aa  289  8e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  36.69 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  38.05 
 
 		 408 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  36.61 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  35.9 
 
 		 387 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  34.06 
 
 		 395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  36.39 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  34.64 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  35.58 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  34.54 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  34.78 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  37.76 
 
 		 414 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  32.74 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  29.47 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.62 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.6 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  30.1 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  36.81 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.11 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  34.33 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  35.14 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  31.19 
 
 		 409 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  38.05 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  32.79 
 
 		 411 aa  142  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  31.39 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  25.77 
 
 		 374 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  32.92 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.44 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  35.03 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  36.48 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  31.59 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  29.53 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.99 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.5 
 
 		 400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  30.26 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  35.27 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  34.88 
 
 		 409 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.5 
 
 		 400 aa  136  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  32.57 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  36.16 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  32.45 
 
 		 517 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  27.75 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  29.3 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.65 
 
 		 418 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  31.94 
 
 		 410 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  30.23 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.91 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  29.07 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.04 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  29.07 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  32.46 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  29.67 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  33.22 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  27.58 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  26.19 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  30.02 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  26.67 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.08 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  27.23 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  27.39 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.24 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  26.19 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  26.19 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  28.38 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.42 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  26.19 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  33.88 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  30.29 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  25.95 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  29.45 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  27.91 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  30.31 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  34.51 
 
 		 379 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  37.17 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  30.43 
 
 		 410 aa  127  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  32.49 
 
 		 390 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  30.52 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.88 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  30.09 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  29.38 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  28.81 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  29.74 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  29.1 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  35.26 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  25.06 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  27.76 
 
 		 372 aa  124  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  29.48 
 
 		 386 aa  124  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  25.41 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  29.1 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  29.1 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  25.6 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  30.36 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  28.03 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  29.18 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>