288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0983 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  100 
 
 		 387 aa  780    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  64.74 
 
 		 386 aa  471  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  41.03 
 
 		 395 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  38.55 
 
 		 390 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  38.25 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  37.5 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  42.29 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  35.03 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  34.59 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  29.15 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  35.11 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.21 
 
 		 435 aa  143  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  35.82 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  35.58 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  27.47 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  27.69 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  30.26 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  30.49 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  32.53 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  23.62 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  29.65 
 
 		 408 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  32.17 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  33.72 
 
 		 409 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  29.84 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  29.84 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.7 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  29.07 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  27.61 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  27.63 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  26.4 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  31.15 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  26.4 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  26.93 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  34.87 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  31.01 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  28.57 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  30.62 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  31.01 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  30.67 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  31.23 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  30.3 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  25.47 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  26.47 
 
 		 409 aa  103  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  30.62 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  24.94 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  30.23 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  34.87 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.75 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  27.49 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  30.62 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  30.23 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  29.43 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  29.5 
 
 		 401 aa  99.4  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  31.99 
 
 		 415 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  28.83 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  25.64 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  26.02 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  29.01 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  24.17 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  28.2 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  29.05 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  25.73 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  31.2 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  30.71 
 
 		 411 aa  97.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  26.54 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  30.68 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  27.81 
 
 		 414 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  28.89 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  32.32 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.47 
 
 		 418 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  24.26 
 
 		 390 aa  96.7  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.72 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  29.3 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  31.36 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.33 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  31.16 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  30.22 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  29.28 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  29.32 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  27.67 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  29.57 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  29.32 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.1 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  27.57 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  30.2 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  27.57 
 
 		 414 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  27.57 
 
 		 414 aa  94  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  28.72 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  29.32 
 
 		 400 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  26.51 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.61 
 
 		 386 aa  92.8  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  29.8 
 
 		 425 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  28.68 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  28.68 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  28.68 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  28.68 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  28.68 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  28.68 
 
 		 400 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.83 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  28.68 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>