266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1299 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  99.74 
 
 		 382 aa  766    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 382 aa  767    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  24.82 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  30.69 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  25.7 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  33.09 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  28.42 
 
 		 418 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  27.52 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  26.78 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  25.12 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  26.37 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  25.19 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  25.06 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  25.99 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  24.81 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.42 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  30.48 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  26.37 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  23.42 
 
 		 412 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  25.06 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  27.3 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.76 
 
 		 435 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  27.34 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  24.09 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  26.19 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  28.57 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  23.91 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  27.5 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  24.52 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  28.57 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  27.9 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  28.52 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  25.5 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  26.38 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  28.93 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  29.68 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  25.18 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  24.22 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  28.26 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  24.79 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  26.09 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  28.57 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  25.35 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  27.59 
 
 		 515 aa  76.6  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  25.72 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  25.09 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  25.06 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  27.45 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  26.8 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  24.17 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  26.48 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  26.48 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  26.48 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  26.22 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  28.94 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  28.62 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  23.03 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  25.32 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  25.48 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  27.84 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  26.51 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  26.46 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  27.84 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  27.84 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  27.84 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  26.46 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  27.84 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  25.8 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  25.8 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  23.86 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  26.8 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  25.8 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  25.8 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  25.8 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  25.8 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  26.68 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  27.47 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  27.84 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  25.8 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  26.12 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  23.32 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  26.82 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  23.79 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  27.14 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  25.8 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  25.74 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  26.59 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  28.83 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  26.59 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.57 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  24.45 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  24.45 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  24.45 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.6 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.6 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  24.83 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  24.88 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  28 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  25 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>