289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1475 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 
442 aa  891    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  71.74 
 
 
428 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  70.94 
 
 
412 aa  605  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  70.27 
 
 
412 aa  600  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  67.8 
 
 
428 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  68.04 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  67.57 
 
 
427 aa  568  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  40.46 
 
 
418 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  38.98 
 
 
414 aa  285  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  40.21 
 
 
415 aa  279  6e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  39.53 
 
 
417 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  38.97 
 
 
408 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  38.62 
 
 
415 aa  265  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  37.02 
 
 
415 aa  262  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  36.61 
 
 
412 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  27.3 
 
 
420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  29.24 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  30.42 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  31.16 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  30 
 
 
421 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  29.7 
 
 
421 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  27.33 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  28.14 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  25.19 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  28.83 
 
 
377 aa  90.5  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  27.27 
 
 
379 aa  86.7  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.21 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
270 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  25 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  25.61 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  25.36 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.52 
 
 
418 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  27.17 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  26.85 
 
 
382 aa  84  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  25.36 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  28.67 
 
 
383 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  25.36 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  28.92 
 
 
381 aa  84  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  27.42 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  25.36 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  27.65 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  25.87 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  29.06 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  29.43 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  26.04 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  25.87 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  25.99 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  24.14 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  28.67 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  26.76 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  26.76 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  28.41 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  28.41 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  28.41 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  26.69 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  25 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  28.89 
 
 
379 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  28.78 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.3 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2561  DNA repair exonuclease-like protein  27.97 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.215391 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2238  DNA repair exonuclease-like protein  27.66 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74733  normal  0.111488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  25.16 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.91 
 
 
381 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  26.37 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.97 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.25 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  25.77 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  26.24 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.99 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  28.25 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  27.8 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  27.76 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  28.84 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  28.34 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  28.38 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  24.33 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  25.89 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  28.84 
 
 
382 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  26.69 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  24.92 
 
 
381 aa  73.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.97 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  26.89 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  26.55 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.64 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  28.82 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.35 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6788  DNA repair exonuclease-like protein  26.37 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  23.9 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  28.38 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.32 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  23.9 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  25.18 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  40 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  25.18 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  26.1 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  27.09 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  25.74 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  25.18 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>