280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2085 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  73.85 
 
 
428 aa  635    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 
428 aa  876    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  99.07 
 
 
428 aa  866    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  69.7 
 
 
412 aa  607  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  68.63 
 
 
412 aa  600  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  67.8 
 
 
442 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  68.49 
 
 
427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  38.86 
 
 
418 aa  285  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  39.12 
 
 
417 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  37.19 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  37.41 
 
 
415 aa  256  4e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  36.9 
 
 
414 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  34.88 
 
 
408 aa  256  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  36.92 
 
 
415 aa  249  9e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  36.67 
 
 
415 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  27.83 
 
 
420 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  29.26 
 
 
380 aa  96.7  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.59 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  26.24 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.27 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  27.33 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  28.67 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  28.52 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.71 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.5 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  27.68 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  26.92 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  28.96 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  25.32 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  26.09 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  27.34 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  25.21 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  26.86 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  27.81 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  28.16 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  28.16 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  28.16 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  27.56 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.96 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  24.59 
 
 
506 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  25.75 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  25.42 
 
 
413 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  26.35 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  25.75 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  25.42 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  25.59 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  27 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  25.93 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.01 
 
 
390 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  25.72 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  27.66 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  25.72 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.98 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.98 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  26.35 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  24.75 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  27.57 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  26.09 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.42 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  27.02 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.08 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  26.09 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  25.75 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.5 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  43.16 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6788  DNA repair exonuclease-like protein  25.26 
 
 
455 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  26.26 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  26.74 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  26.26 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  26.06 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  24.84 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  27.06 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  27.62 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  24.48 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  24.27 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  25.86 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  26.71 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  24.27 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  24.27 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  26.74 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  24.27 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  26.67 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  24.27 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  25.69 
 
 
387 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  24.6 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  25.88 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  24 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2561  DNA repair exonuclease-like protein  25.17 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.215391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  26.11 
 
 
515 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  23.84 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  26.37 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  24.48 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  23.7 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  24.13 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  25.52 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  22.66 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.74 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  24.1 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  26.73 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>