189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0947 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  100 
 
 
372 aa  768    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  35.66 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
375 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  29.08 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
371 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  25.9 
 
 
372 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  28.47 
 
 
375 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
380 aa  99.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  27.62 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  26.96 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  27.37 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  27.37 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  27.37 
 
 
385 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  27.37 
 
 
385 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  27.37 
 
 
385 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  27.11 
 
 
385 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  38.46 
 
 
399 aa  85.9  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  27.16 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  29.69 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  26.85 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  26.43 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  25.26 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  24.43 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  27.59 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  27.59 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  25.14 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  24.21 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  20.75 
 
 
418 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  22.67 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  23.91 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  26.6 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  26.57 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  25.29 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  22.53 
 
 
415 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  22.91 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  26.73 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  26.59 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  20.55 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2554  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
515 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  24.94 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  24.4 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  26.64 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  25.31 
 
 
428 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  26.77 
 
 
374 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  25.08 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  23.28 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  36.84 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  24.75 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  24 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.13 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  24.82 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  24.21 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  27.39 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  23.37 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  24 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  23.72 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  24 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  21.98 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  27.53 
 
 
485 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.83 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  22.97 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  23.78 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  25.18 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  21.18 
 
 
442 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  25.88 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  20.91 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  26.17 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  35 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  23.81 
 
 
381 aa  63.5  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  25.99 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  25.99 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  25.64 
 
 
479 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  26.5 
 
 
381 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  26.27 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  26.5 
 
 
381 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
386 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  27.37 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  24.12 
 
 
387 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  28.67 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.4 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  26.5 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  24.19 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  20.31 
 
 
408 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  21.08 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  26.67 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  24.23 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  27.33 
 
 
423 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  25.08 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  24.91 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  34.07 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  23.49 
 
 
425 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  27.9 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  25.45 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  20.29 
 
 
386 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  26.35 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  20 
 
 
390 aa  56.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  21.05 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>