203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0984 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  100 
 
 		 384 aa  776    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  73.58 
 
 		 386 aa  595  1e-169  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  73.58 
 
 		 386 aa  560  1e-158  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0357  metallophosphoesterase  66.93 
 
 		 385 aa  528  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  30.1 
 
 		 405 aa  142  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  28.32 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  41.86 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  28.06 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  27.09 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  26.07 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  26.4 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  26.78 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  27.2 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  25.56 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  25.57 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  25.65 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  24.86 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  27.46 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  23.11 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  26.98 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  23.5 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  38.37 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  23.55 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  24.33 
 
 		 485 aa  62.8  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  43.53 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  24.16 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  29.79 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  25.48 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  34.07 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  26.94 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  44.32 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  41.86 
 
 		 409 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  28.47 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  25.38 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  23.57 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  25.33 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  35.05 
 
 		 515 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  37.21 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  42.05 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  39.53 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  38.1 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  26.8 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  24.67 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  40.91 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  28.37 
 
 		 776 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  37.08 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  35.29 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  24.14 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  34.44 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  39.77 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  34.44 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  31.23 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.44 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  35.56 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  24.35 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  35.29 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  25.21 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  39.08 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  26.85 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  35.63 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  35.63 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  21.68 
 
 		 506 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  35.63 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  23.16 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  27.66 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  29.91 
 
 		 483 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  37.36 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  36.78 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  38.64 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  39.08 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  33.94 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  25.81 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  36.05 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1278  metallophosphoesterase  31.97 
 
 		 695 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.48 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  35.23 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  26.79 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  35.63 
 
 		 467 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  35.63 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  34.48 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  34.48 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  36.78 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  35.63 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  35.63 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  34.09 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  34.09 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  37.65 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  32.18 
 
 		 442 aa  50.4  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>