146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1252 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  100 
 
 
425 aa  867    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  55.82 
 
 
428 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  31.55 
 
 
435 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  32.46 
 
 
453 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  30.23 
 
 
421 aa  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  29.16 
 
 
421 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.95 
 
 
418 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  29.05 
 
 
421 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  28.34 
 
 
408 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  23.82 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  26.49 
 
 
414 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  27.75 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  38.83 
 
 
776 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  27.46 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  28.47 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  30.07 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  37.29 
 
 
469 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  29.53 
 
 
379 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  27.4 
 
 
399 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  27.46 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  37.11 
 
 
485 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  37.04 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  26.59 
 
 
438 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
371 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
412 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  37.04 
 
 
421 aa  60.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  26.64 
 
 
395 aa  60.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  23.64 
 
 
416 aa  60.1  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.11 
 
 
379 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0357  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
385 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.67 
 
 
379 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  23.38 
 
 
417 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  37 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  25.67 
 
 
385 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  28.4 
 
 
434 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  26.9 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  27.15 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  27.7 
 
 
449 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.76 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  30.95 
 
 
404 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  24.31 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  27.31 
 
 
413 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  24.13 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  26.92 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  27.18 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  26.91 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  29.33 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  24.6 
 
 
337 aa  54.3  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  25.84 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  26.57 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  25.98 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  26.35 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  25.98 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  26.09 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  26.2 
 
 
432 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  23.89 
 
 
464 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  26.2 
 
 
413 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  25.81 
 
 
445 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  25 
 
 
387 aa  53.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  26.57 
 
 
413 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  27.78 
 
 
432 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  28.21 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  28.14 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  26.46 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  27.35 
 
 
432 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1494  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
488 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  26.57 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  33 
 
 
418 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  21.22 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  34.78 
 
 
415 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  24.39 
 
 
422 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  27.2 
 
 
442 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  21.94 
 
 
420 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  25.63 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  22.22 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  23.51 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  23.67 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.22 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  34.31 
 
 
429 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  33.06 
 
 
404 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  25.68 
 
 
380 aa  50.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  25.17 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  37.5 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  32.69 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  28.02 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  41.3 
 
 
270 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  24.92 
 
 
420 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  25.46 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  25.07 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  33.64 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>