180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1820 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  87.82 
 
 
386 aa  712    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  100 
 
 
386 aa  771    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  73.58 
 
 
384 aa  599  1e-170  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0357  metallophosphoesterase  71.58 
 
 
385 aa  548  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
405 aa  150  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  25.27 
 
 
382 aa  87  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  27.73 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  25.82 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  27.19 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  28.26 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  30.98 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  26.3 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  22.62 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  26.48 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  25.67 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  23.83 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  22.22 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.35 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  47.06 
 
 
423 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  30.07 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  36.47 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  22.95 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  26.3 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  26.69 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  27.97 
 
 
406 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  24.51 
 
 
435 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  23.49 
 
 
485 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  25.92 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  39.29 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  29.83 
 
 
270 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  29.86 
 
 
776 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
372 aa  57  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  37.65 
 
 
469 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  28.15 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  26.64 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  24.91 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  28.76 
 
 
386 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  28.67 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  37.65 
 
 
381 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  39.08 
 
 
406 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  29.15 
 
 
366 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  34.48 
 
 
428 aa  53.1  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  28.5 
 
 
374 aa  53.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  30 
 
 
381 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  34.35 
 
 
370 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  34.48 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  37.07 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  42.53 
 
 
379 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  40.7 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  31.3 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  32.94 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  26.02 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  26.21 
 
 
395 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  28.07 
 
 
382 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  37.21 
 
 
425 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  37.93 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  19.57 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  38.2 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  38.37 
 
 
410 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  30 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  38.64 
 
 
467 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  37.21 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1813  metallophosphoesterase  31.11 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00110244  normal  0.670349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  30.53 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  38.64 
 
 
498 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43144  predicted protein  38.03 
 
 
542 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  0.938333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  40.23 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  32.65 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  28.06 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  22.46 
 
 
506 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  31.46 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  31.76 
 
 
479 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  34.88 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  42.35 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  28.78 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  32.61 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  25.21 
 
 
442 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  36.36 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  32.56 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  35.87 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  35.63 
 
 
410 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  30.17 
 
 
420 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  32.18 
 
 
442 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0509  metallophosphoesterase  22.12 
 
 
355 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  23.56 
 
 
404 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  34.44 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  32.95 
 
 
410 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  30.71 
 
 
270 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  38.82 
 
 
390 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  37.93 
 
 
402 aa  47  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  28.63 
 
 
407 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  42.05 
 
 
381 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  31.76 
 
 
400 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  40.66 
 
 
418 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  31.76 
 
 
400 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  31.76 
 
 
400 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  31.76 
 
 
400 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  29.82 
 
 
405 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>