272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1483 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  100 
 
 
375 aa  773    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  39.05 
 
 
386 aa  256  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  36.43 
 
 
380 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  26.27 
 
 
372 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  29.32 
 
 
372 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  29.32 
 
 
375 aa  90.1  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  28.62 
 
 
354 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  27.03 
 
 
366 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  30.04 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  27.97 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  26.2 
 
 
386 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  27.4 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2554  metallophosphoesterase  24.47 
 
 
515 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
469 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  22.62 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  27.02 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  22.62 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  28.83 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  27.73 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  29.57 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  26.74 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  26.57 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.57 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  28.08 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  28 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  24.64 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  24.13 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.47 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  28.82 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  26.47 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  26.47 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  25.76 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  26.85 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  27.47 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  27.03 
 
 
436 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  26.92 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  26.16 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  25.84 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  25.46 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  24.08 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  25.19 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  27.93 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  26.1 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  27.37 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  26.71 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  27.63 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  25.68 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  25.68 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  24.83 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.37 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.24 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  26.37 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  28.89 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  24.48 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  26.37 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  26.37 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  26.37 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  25.84 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.37 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  25.74 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  23.61 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  26.37 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  25.09 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  22.35 
 
 
442 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  26.21 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  25.54 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  25.46 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  24.36 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  25.52 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  25 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.31 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  25.74 
 
 
385 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
485 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  25.09 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  25.25 
 
 
386 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  24.4 
 
 
379 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  25.29 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.49 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  25.18 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  23.81 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.08 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  26.26 
 
 
412 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  24.82 
 
 
415 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  25.86 
 
 
435 aa  63.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  23.27 
 
 
415 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  27.38 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  27.08 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  24.83 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  24.11 
 
 
428 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  24.7 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  25 
 
 
425 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  35.11 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  25.7 
 
 
409 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  24.56 
 
 
428 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.64706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>