293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3452 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 414 aa  835    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  55.67 
 
 		 418 aa  443  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  54.38 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  50.98 
 
 		 408 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  41.13 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  40.63 
 
 		 415 aa  298  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  41.38 
 
 		 415 aa  296  6e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  38.98 
 
 		 442 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  39.52 
 
 		 412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  37.32 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  37.83 
 
 		 412 aa  278  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  37.99 
 
 		 427 aa  270  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  37.38 
 
 		 428 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  36.9 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  36.03 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  31.25 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  33.92 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  27.97 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  27.97 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  28.3 
 
 		 400 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  27.97 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  28.3 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  29.14 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  29.14 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  29.31 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  28.8 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  28.21 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  28.67 
 
 		 442 aa  87.4  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  27.3 
 
 		 382 aa  87.4  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  27.3 
 
 		 382 aa  86.7  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  27.96 
 
 		 388 aa  86.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  29.58 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  27.89 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  27.39 
 
 		 414 aa  82.8  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  30.14 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  27.14 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  22.51 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  28.85 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  29.39 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  30 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  28.06 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  26.17 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  26.51 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  28.42 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  29.96 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  27.1 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  27.52 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  27.52 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  27.22 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  27.52 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  28.83 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  25.96 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  27.52 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  27.76 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  27.52 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  27.52 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  28.42 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  27.18 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.08 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  27.87 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  27.87 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.5 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  27.87 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  25.84 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  25.33 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  26.07 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  26.76 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  25.27 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  26.36 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.29 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  25.16 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  25.47 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  24.21 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  25.58 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  26.88 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  25.08 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  27.24 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  26.2 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  26.98 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  26.73 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  27.01 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  27.04 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  26.83 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  27.3 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  27.3 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  27.3 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.27 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.6 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.96 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  25.89 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  25.23 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.85 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  26.48 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  25.16 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  26.46 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  26.46 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  27.37 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  20.29 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.23 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  26.46 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>