More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0788 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  88.19 
 
 		 415 aa  754    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 415 aa  845    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  96.14 
 
 		 415 aa  811    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  41.13 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  41.04 
 
 		 418 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  40.8 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  37.84 
 
 		 408 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  38.62 
 
 		 442 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  38.55 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  36.65 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  37.32 
 
 		 428 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  36.19 
 
 		 412 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  37.41 
 
 		 428 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  36.92 
 
 		 428 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  35.7 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  30.58 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  26.9 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  29.89 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  29.89 
 
 		 400 aa  99.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  29.68 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  27.09 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  29.33 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  29.54 
 
 		 400 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  30.66 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  28.16 
 
 		 401 aa  94  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.68 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  29.66 
 
 		 414 aa  93.6  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  29.24 
 
 		 400 aa  92.8  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  29.39 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  28.28 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  28.98 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  26.3 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  29.33 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  29.33 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  29.33 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  29.33 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  29.33 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  28.09 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  28.52 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  28.09 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  29.33 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  28.09 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  29.9 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  28.23 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  30.28 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  27.18 
 
 		 513 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  25.94 
 
 		 409 aa  87  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  25.61 
 
 		 379 aa  87  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  28.17 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  24.65 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  28.03 
 
 		 380 aa  86.3  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  28.16 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  29.58 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.97 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  27.27 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  26.89 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  29.31 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  25.23 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  27.4 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  30.96 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  24.85 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  30.18 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.59 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  29.29 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  29.14 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  26.76 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  28.27 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  28.07 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  25.41 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  26.74 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  27.9 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  27.9 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  28.72 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  27.52 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  27.57 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  29.03 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  27.34 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  27.08 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.08 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  26.95 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  27.78 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  26.51 
 
 		 506 aa  79.7  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  27.54 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  26.7 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  26.35 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  29.02 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  26.58 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  28.41 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  28.52 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  26.91 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  26.6 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  26.51 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  23.91 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  24.19 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  26.56 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  24.6 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  25 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  27.05 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  25.87 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  25.55 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>