289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0493 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  100 
 
 
382 aa  767    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  34.73 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  34.88 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  34.68 
 
 
372 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  30.82 
 
 
381 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  33.45 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  32.67 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  33.64 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  29.6 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  29.08 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.14 
 
 
418 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
469 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  30.21 
 
 
479 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  27.79 
 
 
421 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  29.86 
 
 
421 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  26.99 
 
 
421 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  25.81 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  23.12 
 
 
417 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1494  metallophosphoesterase  28.98 
 
 
488 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  27.18 
 
 
386 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
435 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  27.92 
 
 
428 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
405 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  24.34 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  24.74 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  35.94 
 
 
776 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  25.41 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  26.38 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  25.14 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  29.26 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  25.95 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  23.68 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  29.92 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  26.85 
 
 
442 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  26.67 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  25.27 
 
 
413 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0357  metallophosphoesterase  37.68 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  28.52 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  25.5 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  22.51 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  27.46 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  25.07 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  24.69 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  26.9 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  25.07 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  28.17 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  26.52 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  26.35 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  25.07 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  25.67 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  26.15 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  24.53 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  24.46 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  26.17 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  28.33 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  41.86 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  27.84 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  26.79 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  28.76 
 
 
415 aa  77  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  25 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  40.7 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  24.8 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  24.73 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  26.58 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.45 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  26.02 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  25 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  26.62 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  24.75 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  24.62 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  24.62 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  36.36 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  24.91 
 
 
464 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  22.86 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
394 aa  69.3  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  24.7 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  27.92 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  23.17 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  26.58 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  30.18 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  22.59 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  26.48 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  26.17 
 
 
428 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1751  metallophosphoesterase  26.52 
 
 
330 aa  67  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  24.46 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  25.53 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  21.96 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43144  predicted protein  25.09 
 
 
542 aa  66.2  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  0.938333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  23.02 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  22.49 
 
 
438 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.49 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  25.55 
 
 
379 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  25.43 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
429 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  22.56 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  26.26 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  21.99 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.65 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>