275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2302 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  96.44 
 
 
421 aa  828    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  72.44 
 
 
418 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  100 
 
 
421 aa  858    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  66.83 
 
 
421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  32.39 
 
 
435 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
428 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  29.16 
 
 
425 aa  143  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  31.54 
 
 
453 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  30.14 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  30.85 
 
 
397 aa  106  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  26.99 
 
 
382 aa  99.4  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  31.23 
 
 
436 aa  96.3  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  29.7 
 
 
442 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  29.35 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  27.76 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  30.92 
 
 
376 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  30 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  26.92 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  24.6 
 
 
420 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  29.89 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  27.04 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  27.18 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  27.81 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  27.81 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1494  metallophosphoesterase  30.69 
 
 
488 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  26.54 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  26.54 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  26.02 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  26.86 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  26.54 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  26.86 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  27.04 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  30.59 
 
 
479 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  28.82 
 
 
469 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  26.54 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  25.57 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  28.25 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  27.02 
 
 
434 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  27.19 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  22.91 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  27.11 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  26.42 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  25.57 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  24.4 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  30.28 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  25.17 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  26.52 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  27.56 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  27.96 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  26.76 
 
 
485 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  30.84 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  27.92 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  26.27 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  25.29 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  28.21 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  36.45 
 
 
776 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  26.39 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  27.24 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  25.8 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  26.04 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  28.5 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  24.9 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  25.95 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  27.03 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  26.58 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.38 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  27.9 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  26.58 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  28.03 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  26.58 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  26.58 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  26.58 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  26.58 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  28.21 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  26.58 
 
 
385 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  27.84 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  27.38 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  26.16 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  27.37 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  25.38 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  26.43 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  24.81 
 
 
436 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  25.17 
 
 
513 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  22.87 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  25.67 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  27.43 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  24.19 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  25.68 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  25.38 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  25.91 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  24.38 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  24.19 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  26.62 
 
 
372 aa  64.3  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  26.51 
 
 
416 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  25.68 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  26.71 
 
 
375 aa  63.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  24.61 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>