278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1421 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  100 
 
 		 376 aa  758    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  74.47 
 
 		 376 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  32.09 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  30.43 
 
 		 374 aa  153  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.91 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  28.02 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.65 
 
 		 379 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  30.04 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  31.15 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  31.28 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  31.56 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  30.74 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  30.33 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  30.33 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  31.15 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  30.33 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  29.63 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  29.63 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  32.5 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  31.49 
 
 		 410 aa  112  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  34.57 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  31.73 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  29.14 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  33.06 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  30.88 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  31.43 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  28.84 
 
 		 368 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  29.81 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  31.95 
 
 		 430 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  28.75 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  28.75 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  30.36 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  30.12 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  32.22 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  31.8 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  25 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  33.33 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  31.21 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  30.89 
 
 		 416 aa  92.8  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  31.28 
 
 		 448 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  31.75 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  30.49 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  27.18 
 
 		 370 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  27.44 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  26.62 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.09 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  29.78 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  26.77 
 
 		 429 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  32.23 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  30.08 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  30.96 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.37 
 
 		 465 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  28.46 
 
 		 449 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  28.22 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  32.28 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  29.23 
 
 		 513 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 436 aa  87.4  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  31.97 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  30.92 
 
 		 421 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  31.84 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  31.54 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  28.03 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  28.39 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  31 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  29.74 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  26.27 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  29.87 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  31.45 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  30.29 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  25.81 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  31.1 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  27.61 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  27.61 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.8 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  30.68 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  27.24 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  27.24 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  30.35 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  26.42 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  26.12 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  26.79 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  28.51 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  29.34 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  28.19 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  28.1 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.25 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  27.89 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  26.45 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  30.04 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  25.61 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  27.6 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.91 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  26.72 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.13 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  26.28 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1037  metallophosphoesterase  23.79 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0714312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  27.16 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  25.8 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  26.13 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.95 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>