129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0449 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  100 
 
 		 354 aa  689    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  28.36 
 
 		 380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  30.54 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2554  metallophosphoesterase  29.43 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  29.69 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  28.29 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  23.47 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  22.97 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  26.02 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.19 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  31.43 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  22.94 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  25.18 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  26.73 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  23.08 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  22.86 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  24.3 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  23.1 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  25.17 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  26.98 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  24.09 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  25.41 
 
 		 412 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  28.42 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  30.77 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  27.33 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  24.62 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  27.56 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  26.9 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  22.09 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  27.43 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  30.19 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0697  metallophosphoesterase  24.46 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.03 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  26.69 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  26.32 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  23.83 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  25.83 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  21.99 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  24.51 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  28.33 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  23.19 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  23.19 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  24.16 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  21.47 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  26 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.51 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  22.8 
 
 		 415 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.52 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  23.49 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  25.55 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.2 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  24.76 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  27.59 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  27.65 
 
 		 421 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  28.57 
 
 		 413 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  26.84 
 
 		 270 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  24.6 
 
 		 381 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.24 
 
 		 402 aa  53.1  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  24.58 
 
 		 399 aa  53.1  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  26.82 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  32.02 
 
 		 379 aa  53.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 418 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.36 
 
 		 418 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  28.02 
 
 		 432 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  28.57 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  27.68 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  28.89 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  31.54 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  25.09 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  28.57 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  28.57 
 
 		 413 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  36.67 
 
 		 776 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  28.02 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.74 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  26.99 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  28.02 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  24.78 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  27.23 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  35.48 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  26.01 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  23.74 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  26.05 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  24.93 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  25.44 
 
 		 414 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  25.71 
 
 		 379 aa  49.7  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  24.41 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  33.8 
 
 		 464 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  25.4 
 
 		 436 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  27.68 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  30.29 
 
 		 416 aa  49.7  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.99 
 
 		 416 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  28.14 
 
 		 385 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  33.87 
 
 		 407 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  26.69 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  22 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  27.94 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  25.97 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  24.79 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0357  metallophosphoesterase  27.78 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>