83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2554 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2554  metallophosphoesterase  100 
 
 		 515 aa  1039    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  29.38 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  29.82 
 
 		 354 aa  100  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  28.21 
 
 		 380 aa  98.2  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  27.04 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  28.35 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  26.01 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  27.21 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  23.98 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  24.76 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  25.63 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  22.7 
 
 		 414 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  27 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  30.4 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  23.66 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  24.45 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  26.77 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  25.69 
 
 		 432 aa  54.3  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.21 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  26.59 
 
 		 413 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  32.34 
 
 		 416 aa  53.9  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  25.5 
 
 		 413 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  26.59 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  24.91 
 
 		 415 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  23.72 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  26.19 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  26.76 
 
 		 432 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  25.24 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  27.19 
 
 		 413 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  32.18 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  24.53 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  27.8 
 
 		 416 aa  51.6  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  32.95 
 
 		 382 aa  51.6  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  26.61 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  27.74 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  25.91 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  23.67 
 
 		 398 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  23.67 
 
 		 398 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  29.35 
 
 		 776 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  34.44 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  25.94 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  28.4 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  23.44 
 
 		 361 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  24.79 
 
 		 398 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  24.91 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  25.37 
 
 		 392 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  30.53 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  24.23 
 
 		 417 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  37.5 
 
 		 428 aa  48.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  31.58 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  33.33 
 
 		 418 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  32.63 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  25.64 
 
 		 436 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  25.21 
 
 		 418 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  28.33 
 
 		 411 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  27.84 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  27.04 
 
 		 408 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  31.46 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  27.68 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0039  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.13 
 
 		 361 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.16094e-34  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  25.83 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  22.77 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  25.85 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  27.01 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  25.4 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  31.18 
 
 		 381 aa  45.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  30.53 
 
 		 380 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  25.1 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  26.32 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  27.01 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  22.91 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.59 
 
 		 371 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  26.2 
 
 		 374 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  28.02 
 
 		 422 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  28.18 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  25.52 
 
 		 416 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  26.48 
 
 		 386 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  27.44 
 
 		 408 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  29.27 
 
 		 377 aa  43.9  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  29.11 
 
 		 425 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  25 
 
 		 376 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  25.7 
 
 		 425 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>