176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0102 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  100 
 
 		 361 aa  740    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  28.39 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.75 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.23 
 
 		 379 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  29.95 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  29.89 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  27.05 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  26.95 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  24.12 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  23.77 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  23.77 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  24.18 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  22.79 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  23.55 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  23.36 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  23.77 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  23.08 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  24.18 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  23.77 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  23.77 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  23.77 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  30.13 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  31 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  24.91 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  25.65 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  24.29 
 
 		 413 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  28.64 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  28.45 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  25.19 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  26.6 
 
 		 416 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  28.42 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  26.58 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.77 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  25.55 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  25.76 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  25.18 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  28.74 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  25.58 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  23.24 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  25.19 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  26.57 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  23.85 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.28 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  23.53 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  27.54 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  26.98 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  25.35 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  25.23 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  24.03 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  26.95 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  24.64 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  26.59 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  26.15 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  26.15 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  26.71 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  25.83 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  25.11 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  25.49 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  24.9 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  25.55 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  23.66 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.74 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  24.67 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  23.85 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  27.09 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  25.23 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  24.41 
 
 		 408 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  25.31 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  26.89 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  22.63 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  22.85 
 
 		 420 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.05 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  24.34 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  25.34 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  29.58 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  23.05 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  26.19 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  25.2 
 
 		 396 aa  53.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  26.92 
 
 		 449 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  26.46 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  27.67 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  24.56 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  21.37 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  24.81 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  26.05 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.55 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.95 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  24.78 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  24.02 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  21.74 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  24.1 
 
 		 407 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  25.37 
 
 		 418 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  24.67 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  22.5 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  23.69 
 
 		 385 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.42 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>