171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2312 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  100 
 
 		 513 aa  1005    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  47.01 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.67 
 
 		 465 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  39.66 
 
 		 436 aa  326  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  34.89 
 
 		 436 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  36.89 
 
 		 422 aa  242  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  33.57 
 
 		 420 aa  226  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  30.86 
 
 		 413 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  29.9 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  29.67 
 
 		 413 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  29.67 
 
 		 413 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  29.19 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  29.21 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  29.56 
 
 		 432 aa  196  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  29.23 
 
 		 432 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  29.23 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  28.95 
 
 		 413 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  29.43 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  31.48 
 
 		 435 aa  190  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  35.79 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  32.39 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  32.39 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  32.19 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  32.85 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  32.9 
 
 		 416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  38.65 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  39.71 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  38.87 
 
 		 418 aa  158  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  35.16 
 
 		 425 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  32.52 
 
 		 394 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  31.05 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  35.69 
 
 		 422 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  27.51 
 
 		 464 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  32.91 
 
 		 425 aa  146  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  32.13 
 
 		 390 aa  146  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  31.87 
 
 		 429 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  31.79 
 
 		 408 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  29.6 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  34.91 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  31.97 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  36.07 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  36.23 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  28.74 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  35.87 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  29.08 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  35.87 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  30.35 
 
 		 416 aa  131  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  35.64 
 
 		 416 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  35.64 
 
 		 416 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  30.31 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  34.89 
 
 		 418 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  34.49 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  35.27 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  35.14 
 
 		 416 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  30.49 
 
 		 407 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  33.82 
 
 		 416 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  32.98 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  30.85 
 
 		 449 aa  123  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  30.53 
 
 		 410 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  34.28 
 
 		 412 aa  120  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  32.65 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  33.1 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  31.41 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  28.88 
 
 		 407 aa  117  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  29.18 
 
 		 404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  29.75 
 
 		 410 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  34.65 
 
 		 428 aa  100  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  30.66 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  26.89 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.23 
 
 		 376 aa  87  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  23.63 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.35 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  31.51 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.52 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  32.07 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  25.72 
 
 		 415 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  31.63 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  26.67 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  26.74 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  31.44 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  29.72 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  25.24 
 
 		 455 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  25.08 
 
 		 379 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3342  DNA repair exonuclease-like protein  27.9 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.952092  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  28.3 
 
 		 368 aa  67  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  25.67 
 
 		 421 aa  66.6  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  25.06 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  24.92 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  27 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  26.92 
 
 		 420 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  22.97 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  24.48 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  27.18 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.15 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  24.41 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  27.67 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  22.93 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  25.42 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  25.93 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  25.68 
 
 		 374 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>