198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5392 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  100 
 
 		 374 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  60.22 
 
 		 374 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  45.68 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  42.9 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  38.8 
 
 		 378 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  38.98 
 
 		 375 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  37.06 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  39.66 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.05 
 
 		 371 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  36.68 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  34.11 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  35.12 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  39.12 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  35.12 
 
 		 380 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  32.54 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  30.65 
 
 		 445 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  31.58 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  29.34 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  32.32 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  36.17 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  32.07 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  31.55 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  28.91 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  28.99 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  29.5 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  29.27 
 
 		 375 aa  96.7  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  28.02 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  29.2 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  29.2 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.72 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  26.09 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  25 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  23.18 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  24.76 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  24.68 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  24.68 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  24.68 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  24.64 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  24.64 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.79 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  25.91 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  24.05 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  31.93 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  24.29 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  22.26 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.81 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  24.36 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  27.8 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.07 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  31.33 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  28.45 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  37.63 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  35.48 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  26.79 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  34.51 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  22.11 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  38.24 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  25.81 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  34.04 
 
 		 517 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  26.61 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  26.25 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  22.82 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  34.04 
 
 		 537 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  25.52 
 
 		 513 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  27.56 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  22.87 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  25.53 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.04 
 
 		 528 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  22.74 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  36.36 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  30.88 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  30.88 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  30.88 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  30.88 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  30.88 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  22.58 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  30.88 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  30.88 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  30.88 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  31.46 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  25.48 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  22.77 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  22.77 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  32.98 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  30.88 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  30.88 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  30.88 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  25.09 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.11 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  30.88 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  24.16 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  30.88 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  23.36 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  26.77 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  31.86 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  26.73 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  21.2 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  35.48 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  30 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>