278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1914 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 390 aa  775    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  50.13 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  47.8 
 
 		 388 aa  345  8e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  50.52 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  50.26 
 
 		 382 aa  332  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  49.74 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  38.55 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  37.54 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  30.33 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  35.8 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  36.39 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  36.68 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  32.55 
 
 		 392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  33.53 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  35.74 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  34.4 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  36 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  27.03 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  29.41 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.03 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.06 
 
 		 435 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  30.36 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  31.68 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  33.44 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  33.83 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  32.8 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  34 
 
 		 410 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 408 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.46 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  31.66 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  31.94 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  30.13 
 
 		 498 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  26.7 
 
 		 408 aa  137  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  29.66 
 
 		 442 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  30.84 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  31.53 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  33.14 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  31.12 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  28.02 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  30.84 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  27.98 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  30.29 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  30.84 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  33.16 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  30 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  30.29 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  30.29 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  30.84 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  30.61 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  30.29 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  30.29 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  30.61 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  30.29 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  30.29 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  30.61 
 
 		 414 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  28.44 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  30.41 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  30.03 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  28.8 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  30.24 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  27.52 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.87 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  32.34 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  27.64 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  31.02 
 
 		 517 aa  126  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  32.49 
 
 		 515 aa  126  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.17 
 
 		 418 aa  126  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  28.07 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  32.39 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  33.22 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  26.19 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.22 
 
 		 528 aa  124  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  30.97 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  36.26 
 
 		 537 aa  123  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  28.57 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  27.33 
 
 		 385 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  27.55 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  29.65 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  27.05 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  28.29 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.32 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  29.91 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  31.95 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  26.77 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  27.71 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  31.4 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  29.3 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  26.77 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.32 
 
 		 400 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  28 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  28 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  28 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  28 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  28 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  28 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  26.77 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  23.23 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.75 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.75 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  26.12 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>