117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11303 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  822    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  73.76 
 
 
382 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  74.24 
 
 
383 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  74.24 
 
 
383 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  70.6 
 
 
383 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  75.07 
 
 
383 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  52.24 
 
 
379 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  48.3 
 
 
385 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  43.81 
 
 
379 aa  259  6e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  36.94 
 
 
375 aa  177  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  33.42 
 
 
445 aa  137  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  33.44 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.33 
 
 
371 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  29.89 
 
 
377 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  33.65 
 
 
361 aa  125  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  31.97 
 
 
396 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  29.72 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  32.18 
 
 
373 aa  120  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  33.02 
 
 
383 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  31.55 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
378 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  31.11 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  29.74 
 
 
370 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  30.49 
 
 
363 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  28.92 
 
 
404 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  28.35 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  28.2 
 
 
380 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  28.06 
 
 
380 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  28.87 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  26.55 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  27.6 
 
 
386 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  27.08 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  25.31 
 
 
421 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  20.08 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  20.78 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  27.48 
 
 
421 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  29.69 
 
 
376 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  29.56 
 
 
390 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.67 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  24.58 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  25.17 
 
 
418 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  24.63 
 
 
417 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  25.95 
 
 
428 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  26.4 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  24.8 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  24.8 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  20.6 
 
 
337 aa  54.3  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27 
 
 
418 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  25.72 
 
 
415 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  22.85 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  27.72 
 
 
419 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  25.28 
 
 
421 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  26.55 
 
 
387 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  26.33 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  36.44 
 
 
423 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  22.13 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  22.34 
 
 
390 aa  51.2  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  25.59 
 
 
415 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  28.83 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  29.37 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  22.87 
 
 
464 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  28.02 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  26.43 
 
 
410 aa  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.77 
 
 
465 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  29.82 
 
 
429 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  26.6 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  34.38 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  26.07 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  38.46 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  25.11 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  29.04 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  38.46 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  25.5 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0509  metallophosphoesterase  22.95 
 
 
355 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  23.68 
 
 
394 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  24.43 
 
 
408 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  24.72 
 
 
375 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  36.96 
 
 
387 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  34.43 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  23.86 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  23.86 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  25.38 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  20.45 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  24.78 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  25.81 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  25.96 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  22.97 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  28.85 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  25.38 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  23.86 
 
 
414 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  28.85 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  22.81 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  24.78 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  23.86 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  23.76 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  25.47 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  24.16 
 
 
410 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  26.81 
 
 
412 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  31.63 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>