172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7589 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  100 
 
 
418 aa  852    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  61.87 
 
 
416 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  61.87 
 
 
416 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  61.39 
 
 
416 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  61.39 
 
 
416 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  61.39 
 
 
416 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  61.39 
 
 
416 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  60.91 
 
 
416 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  58.13 
 
 
430 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  46.02 
 
 
423 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  46.59 
 
 
411 aa  319  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  44.12 
 
 
425 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  45.38 
 
 
416 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  44.7 
 
 
429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  43.41 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  46.83 
 
 
419 aa  297  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  45.05 
 
 
412 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  46.94 
 
 
416 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  40.82 
 
 
410 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
416 aa  288  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  41.79 
 
 
449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  40.34 
 
 
408 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  41.79 
 
 
407 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  40.9 
 
 
416 aa  276  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  41.41 
 
 
408 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  41.1 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  41.04 
 
 
429 aa  269  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  42.39 
 
 
412 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  42.77 
 
 
425 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  45.78 
 
 
405 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  39.88 
 
 
404 aa  249  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  39.04 
 
 
418 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  39.09 
 
 
418 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  35.42 
 
 
425 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  42.05 
 
 
418 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  36.94 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  33.16 
 
 
410 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  33.75 
 
 
413 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  34.78 
 
 
413 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  33.12 
 
 
413 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  32.49 
 
 
413 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  32.7 
 
 
413 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  33.12 
 
 
432 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  32.49 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  32.49 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  32.18 
 
 
432 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  30.37 
 
 
422 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  34.31 
 
 
413 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  33 
 
 
413 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  29.4 
 
 
436 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  31.91 
 
 
413 aa  161  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  30.69 
 
 
420 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  33.82 
 
 
394 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  35.32 
 
 
398 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  35.32 
 
 
398 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  31.75 
 
 
398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  33.54 
 
 
420 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  31.93 
 
 
436 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  30.2 
 
 
407 aa  150  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  30.1 
 
 
464 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  35.07 
 
 
448 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.5 
 
 
465 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  28.62 
 
 
435 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  33.91 
 
 
390 aa  137  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  35.25 
 
 
513 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.47 
 
 
379 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.2 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  28.03 
 
 
434 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  26.38 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  29.35 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  27.15 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.74 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.04 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  25.36 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  24.74 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  26.87 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  25 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  26.07 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  22.88 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  22.11 
 
 
379 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  23.75 
 
 
368 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  24.85 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.02 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  25.98 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  25.97 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  22.67 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  25.09 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  23.33 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  22.71 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  24.78 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  22.63 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  27.15 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  21.65 
 
 
414 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  24.75 
 
 
392 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  24.13 
 
 
425 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  35.42 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  34.69 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  24.43 
 
 
373 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>