121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3539 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  100 
 
 
404 aa  833    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  40.59 
 
 
416 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  40.59 
 
 
416 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  40.6 
 
 
416 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  40.6 
 
 
416 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  40.33 
 
 
416 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  40.59 
 
 
416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  41.35 
 
 
416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  40.29 
 
 
419 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  39.6 
 
 
416 aa  262  8e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  36.14 
 
 
423 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  37.53 
 
 
412 aa  260  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  36.95 
 
 
407 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  36.7 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  35.7 
 
 
410 aa  252  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  37.74 
 
 
411 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  35.68 
 
 
408 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  37.83 
 
 
418 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  38.11 
 
 
412 aa  250  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  39.14 
 
 
411 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  39.27 
 
 
434 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  36.16 
 
 
408 aa  242  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  38.38 
 
 
416 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  37.02 
 
 
449 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  38.74 
 
 
416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  35.52 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  37.86 
 
 
429 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  36.63 
 
 
416 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  36.21 
 
 
425 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  35.94 
 
 
405 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  37.98 
 
 
429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  35.07 
 
 
425 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  32.72 
 
 
422 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  35.21 
 
 
418 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  35.42 
 
 
418 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  35.29 
 
 
418 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  33.86 
 
 
432 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  34.19 
 
 
413 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  34.19 
 
 
413 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  34.17 
 
 
413 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  34.71 
 
 
432 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  34.71 
 
 
413 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  33.87 
 
 
413 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  32.25 
 
 
413 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  32.59 
 
 
413 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  32.59 
 
 
432 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  32.42 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  37.24 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  36.39 
 
 
394 aa  169  8e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  35.29 
 
 
436 aa  169  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  31.37 
 
 
422 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  32.89 
 
 
398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  32.31 
 
 
398 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  32.31 
 
 
398 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  35.53 
 
 
390 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  33.44 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  30.23 
 
 
420 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  32.31 
 
 
448 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  31.84 
 
 
413 aa  133  6.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.65 
 
 
465 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  29.48 
 
 
428 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  29.43 
 
 
436 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  30.45 
 
 
464 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  29.71 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  29.18 
 
 
513 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  28.31 
 
 
435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.81 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.23 
 
 
379 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  28.34 
 
 
428 aa  96.7  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  30.14 
 
 
423 aa  87  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  23.62 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.61 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  23.76 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  26.03 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  25.86 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.5 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  25.36 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  25.43 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  25.41 
 
 
428 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  24.46 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  21.33 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  22.94 
 
 
374 aa  63.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  20.16 
 
 
415 aa  63.2  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  22.77 
 
 
442 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  24.29 
 
 
415 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  23.38 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3342  DNA repair exonuclease-like protein  25 
 
 
442 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.952092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  23.28 
 
 
428 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  23.69 
 
 
391 aa  56.6  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  23.02 
 
 
415 aa  56.2  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  24.04 
 
 
412 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  21.07 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  25.1 
 
 
418 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  22.74 
 
 
409 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  25.17 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  23.61 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  22.5 
 
 
361 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  24.71 
 
 
408 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  24.53 
 
 
445 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  26.89 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>