153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3216 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  100 
 
 		 418 aa  820    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  98.09 
 
 		 418 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  70.36 
 
 		 418 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  46.79 
 
 		 425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  46.06 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  43.86 
 
 		 410 aa  295  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  38.17 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  37.37 
 
 		 418 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  37.7 
 
 		 416 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  37.7 
 
 		 416 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  35.59 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  41.49 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  36.68 
 
 		 416 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  38.19 
 
 		 416 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  37.53 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  37.18 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  38.08 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  36.83 
 
 		 416 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  36.5 
 
 		 408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  38.48 
 
 		 429 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  36.58 
 
 		 411 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  35.32 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  35.32 
 
 		 430 aa  213  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  38.6 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  36.15 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  38.39 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  36.04 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  37.11 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  37.76 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  35.71 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  36.32 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  38.92 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  35.28 
 
 		 429 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  33.92 
 
 		 449 aa  192  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  34.4 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  31.89 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  32.8 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  32.08 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  34.53 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  31.79 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  31.48 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  31.17 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  38.91 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  30.86 
 
 		 432 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  30.86 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  30.56 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  30.25 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  30.56 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  29.94 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  31.38 
 
 		 413 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  39.71 
 
 		 513 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  29.94 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  30 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  33.09 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.75 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  29.18 
 
 		 398 aa  151  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  28.11 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  28.11 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  32.27 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  33.08 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  29.71 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  32.49 
 
 		 436 aa  136  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  31.23 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  28.62 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  32.26 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  33.46 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  29.2 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.29 
 
 		 379 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  33.06 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.11 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  24.92 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  30.88 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  30.95 
 
 		 428 aa  86.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  30 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  29.07 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  24.74 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  28.25 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  29.52 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  29.79 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  29.87 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.44 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  25.96 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  21.43 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  27.52 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  31.15 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  23.08 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  26.62 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  28.09 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  26.72 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  28.46 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  24.62 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  23.91 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  24.24 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3342  DNA repair exonuclease-like protein  26.12 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.952092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  25.19 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.23 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  24.15 
 
 		 379 aa  53.9  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  26.07 
 
 		 421 aa  53.1  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.2 
 
 		 387 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  22.01 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>