189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2411 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  100 
 
 		 381 aa  785    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  37.5 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  33.25 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.47 
 
 		 379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.95 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.02 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  28.39 
 
 		 361 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  27.44 
 
 		 368 aa  109  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  23.34 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  26.6 
 
 		 425 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  28.77 
 
 		 413 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  26.65 
 
 		 445 aa  96.7  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  26.91 
 
 		 413 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  27.37 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.96 
 
 		 465 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  28.27 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  27.02 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  23.76 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  27.72 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  25.99 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  27.66 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  30.22 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  25.98 
 
 		 422 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  25.8 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  25.18 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  25.77 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  27.37 
 
 		 432 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  27.59 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  26.15 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  27.15 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  27.36 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  26.43 
 
 		 409 aa  89.7  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  25.56 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  28.06 
 
 		 448 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  25.56 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  27.99 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  27.99 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 410 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  25.61 
 
 		 435 aa  87  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  25.56 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  25.56 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  28.45 
 
 		 436 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  25.19 
 
 		 416 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  25.24 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  24.81 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  24.81 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  26.38 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  23.63 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  21.97 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  26.16 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  23.62 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  24.24 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0896  metallophosphoesterase  29.67 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  26.07 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  25.65 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  21.37 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  23.61 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  30.3 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  25.85 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  27.92 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  27.17 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  24.5 
 
 		 434 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  29.8 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  28.17 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  30.53 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  24.62 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  26 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  27.2 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  26.36 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  29.65 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  22.55 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  23.4 
 
 		 416 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  22.76 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  25.11 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  23.51 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  24.91 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  24 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  23.21 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  23.83 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1037  metallophosphoesterase  27.5 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0714312  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  25.65 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  24.9 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  25.11 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  22.57 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  25.32 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  23.18 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  25.18 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  25.88 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  20.93 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  23.84 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  23.77 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  28.08 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  22.62 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  28.63 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  24.31 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  25.42 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  25.91 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  28.23 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  24.8 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  25.73 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>