160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0896 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0896  metallophosphoesterase  100 
 
 
402 aa  825    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1037  metallophosphoesterase  38.15 
 
 
362 aa  276  4e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0714312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  28.23 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  25.44 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.1 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.19 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  24.77 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  26.64 
 
 
413 aa  63.5  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  26.92 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  28.5 
 
 
422 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  23.96 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  26.36 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.26 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  33.72 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  35.78 
 
 
412 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  29.5 
 
 
382 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  25.32 
 
 
382 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  33.96 
 
 
408 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  25.32 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.97 
 
 
337 aa  53.9  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  25.29 
 
 
408 aa  53.9  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  25.59 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  24.89 
 
 
435 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  30.2 
 
 
370 aa  53.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  34.38 
 
 
390 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  28.86 
 
 
400 aa  53.1  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  31.3 
 
 
400 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  31.3 
 
 
400 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  31.3 
 
 
400 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  31.3 
 
 
400 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  31.3 
 
 
400 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  29.77 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  29.77 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  29.77 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  36.05 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  36.05 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  29.77 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  23.45 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  29.77 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  29.77 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  36.47 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  29.77 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  29.77 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  22.07 
 
 
425 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  21.62 
 
 
277 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  25.45 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  27.43 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  38.82 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  34.88 
 
 
406 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  28.3 
 
 
442 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  29.01 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  35.29 
 
 
412 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  24.02 
 
 
409 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  24.37 
 
 
386 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  24.89 
 
 
381 aa  49.7  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  25.22 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  24.15 
 
 
368 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.99 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  31.4 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  32.94 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.88 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  26.54 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  24.52 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  35.29 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  31.11 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  35.29 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  32.56 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  35.29 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  23.26 
 
 
425 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  34.12 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  25.85 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  26.61 
 
 
517 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  27.85 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  25 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  25.33 
 
 
429 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  23.83 
 
 
418 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  34.12 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  28.25 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  32.58 
 
 
506 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  36.05 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  24.89 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  34.88 
 
 
392 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  21.65 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  21.65 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  24.89 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  32.94 
 
 
410 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  24.89 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  24.89 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  24.15 
 
 
432 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  24.04 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  24.04 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  24.51 
 
 
361 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  23.94 
 
 
436 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  28.18 
 
 
388 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  24.4 
 
 
416 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  24.04 
 
 
416 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  37.21 
 
 
498 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>